分色滤色片是CCD的第二层，（把CCD分为三层，第一层为微型镜头，第二层为分色滤色片，第三层是感光层）目前有2种分色方式，一是RGB原色分色法，另一个则是CMYK补色分色法，这两种方法各有优缺点。
RGB即三原色分色法，它是几乎所有人类眼镜可以识别的颜色都可以通过红、绿和蓝来组成，RGB三个字母分别就是红（Red，R）绿（Green，G）和蓝（Blue，B），RGB分色法是通过这三个通道的颜色调节而成。
CMYK，它是由四个通道的颜色配合而成，他们分别是青（Cyan，C）、洋红（Mangenta，M）、黄（Yellow，Y）、黑（BLACK，K）。中国仪器超市（www.cimart.com.cn）介绍，在印刷业中，CMYK更为适用，但其调节出来的颜色不及RGB的多。
原色CCD在于画质锐利，色彩真实，但是有噪声问题。因此，一般采用原色CCD的数码相机，在ISO感光度上多半不会超过400。相对的，补色CCD多了一个Y黄色滤色器，在色彩的分辨上比较仔细，牺牲了部分影像的分辨率，在ISO值上，补色CCD可以容忍较高的感光度，一般都可设立在800以上。
