印第安人是殖民主义者最早的掠夺和奴役对象,因而他们也最早起而进行反抗斗争在整个殖民统治时期，印第安人的起义遍及拉丁美洲各个地区,其中规模较大的是发生于1780～1781年的图帕克阿马鲁起义1535年爆发的曼科起义1742年胡安·桑托斯领导的起义等。其中图帕克·阿马鲁起义具有鲜明的反对种族压迫和反对剥削阶级的性质。起义的领导者J.G.孔多尔坎基以恢复印加帝国为口号，自称为图帕克·阿马鲁二世，试图重建独立的秘鲁国家。起义得到各地印第安人的响应，队伍很快发展到 6万人，数月内占领了秘鲁的大部分领土。由于战略失策、土生白人背叛等因素，起义最后失败，图帕克·阿马鲁二世壮烈牺牲。
起义领导者 J.G. 孔多尔坎基是末代印加王图帕克·阿马鲁一世后裔，曾任廷塔省潘帕尔卡、通加苏卡与苏里马纳三村酋长。他目睹各地印第安同胞在西班牙殖民统治下遭受的苦难，特别是在波托西矿山服"米塔"制劳役者的悲惨命运,1777年向利马殖民当局请愿,要求废止苛政。请愿无效,遂密谋起义。1780年11月初,孔多尔坎基逮捕并处死民愤极大的廷塔省地方长官，发动起义，他恢复印加国年号，袭称图帕克·阿马鲁二世（1780～1781在位）向各地发出通告，号召不同种族的人团结一致,打倒为非作歹的西班牙殖民官吏,并宣布废除万恶的米塔制和强迫印第安人购物的“商品摊派制”，减少捐税。11月16日颁布解放奴隶令。印第安人和部分黑人、贫穷的印欧混血种人甚至少数土生白人纷纷响应号召，揭竿而起。11月18日，起义者在圣加拉拉击败来自库斯科的西班牙军，声威大振。图帕克·阿马鲁二世率得胜之师南下。起义队伍迅速扩大至 6万人，并控制了若干省份。12月，起义军回师北上，围攻库斯科。殖民当局利用印第安部族间的矛盾，煽动当地部分印第安酋长率其部众协同城内防军对抗起义者。为避免印第安人间的自相残杀，图帕克·阿马鲁二世于次年1月撤围退兵。2月，西班牙国王派至秘鲁总督区的视察官J.A.de阿雷切调集军队 1.5万人，分五路进攻起义者。因叛徒出卖，图帕克·阿马鲁二世于4月被俘，5月遇害。孔多尔坎基死后，其弟迭戈继续以图帕克·阿马鲁的名义率领起义者坚持战斗,并得到拉巴斯、奥鲁罗（今秘鲁北部）等地印第安人起义响应。殖民当局调动大军围剿，同时施展招抚诡计。迭戈受骗，于1782年初签订停战协定，不久被殖民统治者逮捕并处死。其余各地的起义也渐被镇压。
拉丁美洲民族解放运动的先驱，秘鲁印第安人反对西班牙殖民统治起义的领导人。原名何塞·孔多尔坎基，出生在秘鲁廷塔省苏里马纳村一个印第安人酋长家庭。他10岁人教会学校读书，在校期间，聪慧好学，博览群书，学会了拉丁文和西班牙文。德拉维加所著《印加列王传》一书使他深受感动，引起了他对印加故国的向往。毕业后回到故乡。26岁继任了父亲管辖3个村子的酋长职务。
孔多尔坎基继任酋长后，深切同情当地人民的悲惨遭遇，尽量减轻人民负担，因而受到人民的拥护和爱戴。西班牙殖民当局怀疑他有反叛之心，一度撤了他的酋长职务。1770年，他前往利马，向殖民当局陈述印第安人的不幸，为自己的同胞请命，被殖民当局拒绝。回乡后，他正式袭用其先祖、末代印加王图帕克·阿马鲁一世的名字，自称图帕克·阿马鲁(史称图帕克·阿马鲁二世)，表明追随祖先，为恢复印第安人的权益而斗争的决心。1777年，他再次去利马向殖民当局递交请愿书，恳请西班牙国王废除米达制(一种徭役)，革除政府弊端，遭到殖民当局的严厉斥责。阿马鲁寄希望于殖民当局的幻想破灭了，于是下决心使用暴力手段，发誓推翻西班牙的殖民统治。返回廷塔以后，着手准备起义。
1780年11月10日，阿马鲁在通加苏卡村召集群众大会，当场处死廷塔省督阿里亚加，正式宣布起义。他号召印第安人、黑人、混血种人和土生白人团结起来，为消灭“西班牙佬”而并肩战斗，并提出“打倒坏政府”的口号，颁发解放黑奴的法令。库斯科城殖民当局闻讯后，慌忙调集殖民军前往镇压，被起义军在加拉拉镇一举击溃。起义的声威随之大振。为给库斯科城士生白人准备起义的机会，阿马鲁率起义军南下，向秘鲁高原和的的喀喀湖一带挺进。大军穿过拉拉亚，攻入拉姆湖，直指阿赞加罗。起义军所到之处，成千上万的印第安人挣脱殖民统治的枷锁，积极参加起义军，投入战斗。在很短的时间内，起义军便在秘鲁的50个省中控制了24个省，人数发展到9万。为了加强对起义的领导，阿马鲁建立了5人内阁，委任了法官和省督吏，并实行新的税收制度，开始履行政府机构的职能。
阿马鲁起义使西班牙殖民当局感到震惊，迅即调动大军，分别从利马和布宜诺斯艾利斯出发，向起义军发动钳形攻势，并高价悬赏收买阿马鲁的首级。1780年12月底，阿马鲁率领起义军6万人围攻印加故都库斯科城。后因情况变化，估计难以取胜，遂决定放弃强攻该城的计划，于1781年1月10日乘夜暗撤围，向南方实行战略转移。
西班牙秘鲁总视察官德阿雷切和巴列元帅获悉，立即统率殖民军跟踪追击。3月21日，阿马鲁率万余起义军，在殖民军必经的一个狭谷里设下埋伏，准备聚歼这股敌人。由于叛徒告密，这次伏击失利，殖民军不仅逃脱了被围歼的命运，而且摸清了起义军的主力所在。随后，在4月6日的切卡库佩战斗中，起义军被强敌打败。阿马鲁被迫突围，然后向南方转移，但在途中又被叛徒出卖而成俘虏。5月18日，他在受尽酷刑后被西班牙当局判处四马分尸之刑，壮烈牺牲，年仅39岁。
阿马鲁领导的这次起义虽然只坚持半年多，但它为秘鲁人民争取民族独立的革命斗争开辟了道路，标志着拉美民族独立战争时代的开始。阿马鲁为拉丁美洲民族解放运动而抛头颅、洒热血的献身精神，他反抗殖民统治的思想，教育和鼓舞了一代又一代的革命家和拉美人民为自由和正义而斗争。1980年11月10日，在纪念他起义200周年的大会上，秘鲁总统庄严地发布命令，授予图帕克·阿马鲁以“秘鲁解放先驱、贤哲和烈士”的光荣称号。
