奇兵队日本近代历史上奇兵队有三，即长州奇兵队、会津奇兵队、西乡军奇兵队。
长州奇兵队奇兵队中最为出名的一支，长州藩常备军之一，成立于1863年（文久3年），所谓奇兵，是指由藩士以外的武士和庶民组成的混成部队，与藩士、武士组成的撰锋队相对。非正规军。
经历了下关战争，长州藩深刻认识到自身军事实力与西方列强的差距，于是按照高杉晋作的提议，着手组建新军。新军的编制及训练被认为受到了高杉的恩师吉田松阴所著《西洋步兵论》的强烈影响。奇兵队设立之初的目的主要是抵御外国军舰，指挥所设在白石正一郎的宅邸，后转移至赤间神宫。
同年，因奇兵队与撰锋队在教法寺事件中互相残杀，高杉晋作引咎辞职。此后，河上弥市、滝弥太郎、赤根武人历任总督，山县狂介任军监。不久，京都爆发八月十八日政变，长州势力遭到驱逐。翌年（1864年），池田屋事件发生之后，长州藩试图武力夺回京都，并与会津藩、萨摩藩武装发生冲突，在后来的禁门之变中，长州藩败北，成为朝敌，随后幕府发动第一次讨伐长州，奇兵队参战。
第一次幕长战争失败后，高杉晋作流亡，但不久归藩，并开始掌握藩政的主导权，一扫藩内的保守势力，明确了长州藩的倒幕方针。元治2年（1865年），第二次幕长战争爆发，奇兵队再次参战，表现不俗。
庆应2年（1866），萨长同盟缔结，两藩合作倒幕。历经大政奉还、王政复古等一系列政治变动，奇兵队正式成为官军一部，参加戊辰战争。其规模上亦有扩大，曾在山口县周防地区组建过第二奇兵队（南奇兵队）。
奇兵队的组建虽然大体上摒除了门阀观念，但仍通过袖印等方式对队员的“阶级成分”加以区别。队员定期从藩厅领取粮饷，日常起居训练也有专门的队舍，因此，奇兵队并不是传统意义上的民兵组织，俨然长州藩的正规部队。其以总督为顶点，下设枪队、炮队，高度组织化。缔造者高杉认为，长期的和平导致了武士的堕落，相比之下，这些出身卑微但迫切渴望出人头地的平民更加具有战斗力。奇兵队的战术训练、武器装备全部西化，战果卓著。
此外，不排斥贱民阶层也是其特点之一。奇兵队成立之初，长州藩曾专门设立过面向贱民阶层的屠勇队，与奇兵队区别对待。但屠勇队最终与奇兵队合并，而且以此为契机，长州藩领导人开始果断的废除等级制度，远见卓识。废除的结果，使贱民阶层的生活水平得到了极大改善。明治维新以后，《（身份）解放令》刚一面世，便激起了全国范围的巨大反感，各地相继发生袭击贱民的骚乱事件。但旧长州藩内相安无事。
倒幕成功，新政府成立以后，随着镇台的设立，奇兵队被废止。明治2年（1869年）部分队员爆发离队骚乱，并包围了山口县厅。骚乱的主事者大乐源太郎后来逃亡九州久留米，密谋再次起事，但遭到木户孝允武力镇压，大乐以下130余人全部被处以极刑。也有说法称，部分奇兵队参加了农民起义，甚至涉足明治初期的士族叛乱。
会津奇兵队会津战争时期，会津藩为对抗维新政府而组建的部队。
西乡军奇兵队西南战争时期，在高濑●田原之战中失利，向矢部浜町方向退却的西乡军将部队编制由大队转换为中队，西乡军奇兵队正是这一编制转换的产物，总指挥野村忍介，主要活动区域丰后国（大分县），西南战争中后期尤其活跃。
