萧瑞芳为中国清朝武官官员，本籍福建。萧瑞芳於1867年（同治6年）奉旨接替江国珍，於台湾地区担任台湾水师协副将。而隶属台湾镇之下的此官职是台湾清治时期的这阶段，全台湾的海防军事层级最高武将，其统帅三标水营，数千名水师兵勇。
前任：
江国珍台湾水师协副将
1867年上任 继任：
吴鸿源