明末三案是指中国明朝末期宫廷中发生的梃击案、红丸案、移宫案的总称。这三期事件本身并不是很重要，但是魏忠贤利用这些事件借机打击东林党，故有“三大案”之称。
事实上早在三大案之前，万历三十一年（1603年）还有妖书案，表面上的问题都是所谓的“国本之争”，但实际上是进行激烈的党争，直到南明灭亡为止。
梃击案万历四十三年（1615年）五月初四日傍晚，有一男子张差，手持枣木棍，闯入太子朱常洛的慈庆宫，打伤守门太监，太子内侍韩本用率众将之逮捕，张差被捕后声称为郑贵妃手下太监庞保、刘成二人引进，主使者遥指郑贵妃本人，此为梃击案。
对张差梃击太子宫之事，朝廷内议论不一。以东林党为代表，认为这是郑贵妃和福王陷害太子的阴谋。而支持福王的人则认为这是张差的疯癫所为。两方争辩不下，互不相让。
后经刑部调查，查明张差是白莲教成员，其首领为马三道、李守才，他们与郑贵妃宫内的太监庞保，刘成勾结，派张差打入宫内，梃击太子宫。
梃击案的发声，加剧了皇太子与郑贵妃之间的矛盾。后来万历帝极力调解，表示了自己立太子的诚意，才使得郑贵妃得以解脱。
红丸案万历四十八年、泰昌元年（1620年）八月，万历帝崩，朱常洛即位为明光宗，淫欲过度，“一生二旦，俱御幸焉。病体由是大剧”，精神劳瘁，司礼秉笔太监用泻药使病情加剧。鸿胪寺丞李可灼进红丸，自称仙方，光宗服药后死去，当时人怀疑为郑贵妃下毒，是为红丸案。大学士方从哲从中调护，事久决不下。天启二年（1622年），崔文升发遣南京，李可灼遣戍。魏忠贤擅权时发案，擢崔文升总督漕运，免李可灼戍。崇祯元年（1628年），魏忠贤败，崔文升始发遣南京。
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移宫案泰昌元年、天启元年（1620年），明熹宗朱由校继位，抚养皇帝的李选侍和魏忠贤利用皇帝年幼把持朝政，左光斗、杨涟等反对，不让李选侍与皇帝同住，迫使她移居他处，是为移宫案。
因主梃击、红丸、移宫的代表人物王之寀、孙慎行、邹元标、杨涟、左光斗等均系东林党人，所以天启初魏忠贤专权后全面翻案，免李可灼戍役，擢崔文升总督漕运，又起用争移宫的御史贾继春等。与东朋党对立的齐、楚、浙诸党官僚都依附魏忠贤，结成阉党，怂恿魏忠贤汇集三案谕旨及争执之词，撰成《三朝要典》，企图一网打尽东林党人，三案遂成为魏忠贤杀人的口实，所以有三大案之名。
