布氏嗜碘阿米巴滋养体直径8 ~20mm，有大而明显核仁的胞核，其与核膜间绕有一层几乎无色的颗粒，这一结构是鉴别的主要特征之一，无核周染色质粒，胞质内含粗大的颗粒和空泡。偶见很大的糖原泡。包囊直径5 ~20mm，成熟包囊仅有一核。主要特点是胞质含圆形或卵圆形、边缘清晰的糖原泡，常把核推向一边，被碘染成棕色团块，铁苏木素染色为泡状空隙。曾引起2例脑膜脑炎误诊，但最终由免疫染色证实为耐格里阿米巴感染，故应注意鉴别诊断，但一般鉴别诊断并不困难。两者所分布的组织不同。布氏嗜碘阿米巴包囊仅有大的糖原泡，可与其他肠内阿米巴鉴别。但结肠内阿米巴时可含小的糖原泡，微小内蜒阿米巴亦有小的胞核，应注意鉴别。本虫分布广泛，但在粪便中检出率偏低，在巴西农村仅为2.3%，阿根廷儿童中仅为0.5%。我国平均感染率为0.559%。