优秀的教学软件,优秀的分子模拟软件
目前最新版本是 Hyperchem8.0
4月新推出的学生版(功能和标准版本相同,在原子数目上有限制)
简介
HyperCam 是一款以高质量,灵活易操作而闻名的分子模拟软件。通过利用 3D 对量子化学计算,分子力学及动力学进行模拟动画, HyperCam 为您提供比其它 Windows 软件更多的模拟工具。
图形界面,有半经验方法( AM1 , PM3 等), UHF , RHF 和 CI 和 7.0 版新增加的密度泛函。可进行单点能,几何优化,分子轨道分析,预测可见 - 紫外光谱,蒙特卡罗和分子力学计算。
功能:
1. 结构输入和对分子操作。
2. 显示分子。
3. 化学计算。用量子化学或经典势能曲面方法,进行单点、几何优化和过渡态寻找计算。可以
进行的计算类型有:单点能,几何优化,计算振动频率得到简正模式,过渡态寻找,分子动
力学模拟 Langevin 动力学模拟, Metropolis Monte Carlo 模拟。支持的计算方法有:从头
计算,半经验方法,分子力学,混合计算。
4. 可以用来研究的分子特性有:同位素的相对稳定性;生成热;活化能;原子电荷; HOMO-LUMO
能量间隔;电离势;电子亲和力;偶极矩;电子能级; MP2 电子相关能; CI 激发态能量;过渡
态结构和能量;非键相互作用能; UV-VIS 吸收谱; IR 吸收谱;同位素对振动的影响;对结构
特性的碰撞影响;团簇的稳定性。
5. 支持用户定制的外部程序。
6. 其它模块: RAYTRACE 模块, RMS Fit , SEQUENCE 编辑器,晶体构造器;糖类构造器,构像搜寻,
QSAR 特性,脚本编辑器。
7. 新的力场方法: Amber 2 , Amber 3 ,用于糖类的 Amber , Amber 94 , Amber 96 。
8. ESR 谱。
9. 电极化率。
10. 二维和三维势能图。
11. 蛋白质设计。
12. 电场。
13. 梯度的图形显示。
14. 新增功能:密度泛函理论 (DFT) 计算; NMR 模拟;数据库; Charmm 蛋白质模拟;半经验方法
TNDO ;磁场中分子计算;激发态几何优化; MP2 相关结构优化;新的芳香环图;交互式参数
控制;增强的聚合物构造功能;新增基组。
7.5 版新增功能:
OpenGL 绘图: 基础的演示模式已全部转换为全新的 OpenGL 模式,使分子演示图形具有更高质量
支持自定义色彩 : 1600 万种颜色代替了传统的 8 种标准色。
混合演示: 棒型,球型或组合型等分子演示手段可以用于该分子的任意原子及链段的演示。原子的
" 管型 " 演示:全新的适用于原子的 " 管型 " 演示 : 全新的适用于原子的 " 管型 " 演示。
增强的蛋白质模型构建功能,支持多种蛋白质次级结构演示,大分子的电子密度近似方法。
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