陈祖生，出生于明正统年间，祖籍靖城前街，其父移居习贤里竹园总（今龙山镇双明村下涂楼）。祖生少年时入宫当太监，由于学问渊博，性情忠厚，天顺皇帝调他到东宫伺候太子（即成化皇帝）读书。后来升任司礼监太监，参与草拟国家机要文件。
成化十三年（1477年），御马监太监汪直利用皇帝委派他负责西厂特务机关之机，敲诈勒索，大兴冤狱，百姓怨声载道，百官敢怒不敢言。陈祖生激于义愤，支持尚书项忠、大学士商辂等人上奏成化皇帝，受到斥责。项忠和商辂均被撤职，陈祖生被贬任南京守备。
弘治四年（1491年）六月，陈祖生母亲柯氏病逝，皇帝派福建布政司右参政魏瀚代为赐祭，诰封六品安人。陈祖生回家奔丧时，带回宫中御用的黑色糯米稻谷，家乡人世代相传播种。
陈祖生逝世后，竹园社隔河对岸建立一座太监亭纪念他，立有《御赐祭文》碑刻。清乾隆九年（1744年），南靖知县姚循义重修，“文化大革命”中被毁。
陈祖生生卒时间无可考。其继子于弘治年间赐录南京锦衣卫指挥，后代聚居竹园社双明村。