昆明市疾病预防控制中心是昆明市人民政府举办公益事业单位，在昆明市卫生局的领导下，具体实施疾病预防控制、卫生检验监测、健康促进与健康教育、公共卫生技术管理和服务、卫生监督执法技术的职能。
昆明市疾病预防控制中心于2002年3月成立，由原昆明市卫生防疫站、昆明市皮肤病防治院、昆明市结核病防治所合并组建而成，是集疾病预防控制、卫生检验、监测与评价、健康教育、信息管理和业务培训与指导为一体的疾病预防控制机构。中心现有人员编制323名，内设34个业务科室和行政职能科室；业务用房8215平方米，有各种监测、检验及诊疗设备720余台（件）、总价值600万元，能够开展微生物、理化和临床检验等200余项。
昆明市疾病预防控制中心贯彻“预防为主”的卫生工作方针，为适应社会经济发展要求、医学模式转变和人民群众不断增长的预防保健需求，将不断提高业务技术水平和疾病预防控制综合能力，为全市人民的身体健康服务，为社会主义现代化建设服务。