医院管理实践是一个系统化的运行过程。这个过程也是一个不断总结经验、教训的过程。医疗改革之前，我国的医疗资源缺乏，“三难四少”——看病难、住院难、手术难，医疗机构少、医护人员少、医院床位少、医疗设备少，成了当时医疗状况的写照。为改变这种状况，国家确立了市场化的改革方向，鼓励社会资本进入医疗领域。医改的市场化方向，结果导致了患者医疗成本的大幅度上升，看病难、看病贵又成为了医改过程中的又一新问题。政府对医院的补偿机制，即使政府不堪重负，也无法从根本上解决这一问题。2005年的医院管理年活动，是医疗改革史上的一件大事，意味着医疗管理在医院实践工作中越来越受到重视。向管理要效益，降低医院的运营成本，是医院走出困境的不二之路。
尽管这些年的医改促使我们的医院管理水平有所提升，但我们同时也应该认识到我国医院管理工作中还存在的问题，主要表现在：（一）医院管理模式尚未适应现代医学模式的转变，重医轻防、医防分离的错误做法仍未从根本上得到纠正；（二）医院领导体制上仍存在党政不分、政医不分、领导班子素质参差不齐等问题；（三）医院在人事制度上的“铁饭碗”问题、人才培养和流动问题还存在不少弊端；（四）分配体制上“大锅饭”和不体现按劳取酬的问题，少数医院“灰色收入”的问题，严重影响部分医务人员的积极性；（五）医院性质、收费标准和国家主渠道之间的矛盾问题，从理论到实践上都尚未理顺；（六）经营管理既存在薄弱的一面，同时也存在不合理收费和看病贵的问题，已成为社会关注的热点之一；（七）行业风气和职业道德建设方面存在的问题尚未从根本上得到解决；（八）在医院管理方面普遍存在医院管理理论落后于管理实践，管理理念又落后于管理理论的状况，医院管理队伍专业化的道路仍然比较遥远；（九）医疗质量上存在问题较多，学科带头人的培养和技术建设方面与国外先进医院的差距较大；（十）医疗法律尚未完善，在医疗纠纷处理方面存在的法津适用和处理办法的矛盾突出。
