肯迪科萨喙鲸Xhosacetus hendeysi和其他喙鲸科成员(除了拿加喙鲸属Nenga)不同之处有相对较大, 长且宽的鼻骨, 侧面边缘粗略平行。肯迪科萨喙鲸Xhosacetus hendeysi和贝喙鲸亚科Berardiinae及喙鲸亚科Ziphiinae不同之处在于前上颌骨弧形脊突上有较短陷的鼻骨 , 吻中管部分被犁骨所填满以至侧壁较厚 , 于贝喙鲸亚科前上颌骨上突呈中等的压缩。肯迪科萨喙鲸Xhosacetus hendeysi和贝喙鲸亚科及喙鲸亚科不同之处在于前上颌骨弧形脊突呈横断的导向 , 和瓶鼻鲸亚科Hyperoodontinae中的翼手喙鲸属Pterocetus及塔喙鲸属Tasmacetus不同之处在于肯迪科萨喙鲸Xhosacetus hendeysi的鼻骨前中不压缩 , 除了瓶鼻鲸亚科的伊科伊喙鲸属 Khoikhoicetus , 前上颌骨上突有轻微的压缩。肯迪科萨喙鲸Xhosacetus hendeysi和塔喙鲸属不同之处在于肯迪科萨喙鲸Xhosacetus hendeysi体型较小, 吻中管被骨化了的犁骨填满 , 有较浅的沟槽 。肯迪科萨喙鲸Xhosacetus hendeysi和利隆喙鲸属Ninoziphius不同之处在于 , 肯迪科萨喙鲸Xhosacetus hendeysi有提高且狭窄的吻突 , 吻中管被骨化了的犁骨填满及较短的上颌骨槽。
