基督教龙港主恩堂建立于1984年，曾先后四次借用信徒家庭作为聚会场所。直到1986年才以65000元人民币购来塑胶厂厂房作为固定聚会场所。堂址座落在苍南县龙港镇环河路20号。
随着龙港不断发展和迁居龙港及新相信信徒的增加，于1990年6月25日在原址上破土动工兴建教堂，至1991年5月8日竣工落成。“主恩堂”堂名由全国政协副主席、时任基督教全国两会主席、会长丁光训主教，于1990年12月8日访问我堂时命名的。
建堂以来，先后有美国、英国、加拿大、非洲及港澳地区教会代表团访问我堂。使我堂在国际知名度得到提高，同时又增进教会之间的了解和灵里交通。
建堂以来，我们亲眼地看到、亲身地经历到主的带领和同在，广大信徒和睦同居、乐作主工奉献身心，教会复兴福音兴旺。教会现有专职工人3位（神学生2位、驻堂1位），教会设“长执会”和“堂委会”分别负责信徒牧养探望和主持处理堂务日常事工并下设22个组。参加圣工的中青年弟兄姊妹约300余人。教会硬件条件不断改善，先后在主、副堂及主日学教室安装了闭路电视、空调和电脑显示屏。主日暨周间聚会正常，并定期举行各种培灵会。教会规章制度及档案不断完善。又于1999年成功地改革以往主日轮流祷告，改为现在的同心出声祷告和圣餐周餐改为月餐，收到了良好的效果。
信徒自1984年的14户增至现在地1300余户，于1997年在人民路730号分设天恩堂，又于2002年经县府民宗局（495）号文件批准登记，在龙港纺织五街160号分设主爱堂。教会现有三支唱诗班（老、中、青）担任主日献诗。主日学七个班级，任课老师25位。1997年创办全县首家由教会创办的老人之家。02、04年暑假成功地举办了大学生团契会。书刊部全天候供应浙南闽东周边教会所需的各种属灵书籍。推动县两会圣经专修班的创办和为苍南教会培养人才提供了基地，县圣经专修班自1993年在我堂创办以来，历办六届先后有200余位青年弟兄姊妹结业，有的考上了浙江、华东、金陵神学院，为缓解苍南教会讲台供应紧缺的局面，起到了不可代替的作用。历年圣诞节感恩奉献款项均名列全市教会之首。我堂还参与全国两会、温州市两会出版发行的《赞美诗新编》、《赞美诗歌增订本》编辑工作。
“主恩堂”顾名思义，主恩实在更多。回想主爱深觉亏欠和软弱，数算主恩心被恩感充满信心，我们决心在群羊的大牧人耶稣基督带领下，与时俱进开拓进取。我堂愿与普世教会一起，在充满希望的21世纪里，为传扬主的福音，付上应有的本份。愿主坚立我们手头所作的工，我们手所作的工愿主坚立；我们相信：在上主的祝福下，这殿后来的荣耀必大过先前的荣耀。
