南京大学校史博物馆及数字化校史博物馆，1999年5月开始筹建，校史博物馆建在南京大学老图书馆（原金陵大学图书馆）内，使用面积1400平方米，展区面积约1000平方米。原中央大学校长、百岁老人顾毓琇为校史博物馆题写了馆名。校史博物馆分“百年校史”、“今日南大”、“百年英才”、“多媒体演示”及“礼品厅”等五个展区。
