哈尔滨医科大学公共卫生学院的前身是1949年5月成立于沈阳的中国医科大学的全国第一个公共卫生学院，1955年全国高校进行院系调整时，把中国医科大学卫生系从沈阳搬迁至哈尔滨医科大学，从此揭开了哈尔滨医科大学公共卫生教育的新篇章.
1981年获首批硕士、博士学位授予权；1989年营养与食品卫生学科被国家教委批准为国家重点学科；1991年，建立公共卫生与预防医学博士后流动站；1995年预防医学专业被评为黑龙江省重点建设专业；1998年，社会医学与卫生事业管理学科获得博士学位授予权，1999年，设长江学者特聘教授岗位；2000年，获得公共卫生与预防医学一级学科博士授予权；2000年，营养与食品卫生学学科、流行病与卫生统计学学科、儿少卫生与妇幼保健学学科、社会医学与卫生事业管理学学科被评为黑龙江省重点学科，2001年，营养与食品卫生学学科再次跻身国家重点学科建设行列；2001年，获国务院学位办批准合作培养社会医学与卫生事业管理硕士研究生授予境外学位项目，2002年，被批准为首批公共卫生硕士学位（MPH）教育试点单位。
学院非常重视人才培养，通过“博士计划”、“土洋结合”等方法培养了大量的博士毕业生。学院现有教职工151人，其中教师99人，教授41人，副教授37人，博士生导师26人，硕士生导师50人。有国务院学位委员会学科评议组成员，国家自然科学基金委员会终审评委，卫生部优秀中青年专家等。20多位教师在全国学术机构和省级学会任主任或副主任委员职务。
学院对教学和科研并重，现有预防医学专业、卫生管理专业、医疗保险专业三个专业，培养各层次的专业人才，近五年来取得教学成果19项。其中国家级教学成果2项，承担国家自然科学基金课题37项，发表科研论文534篇。参加教育部、卫生部规划教材51部，其中主编12部，副主编6部。2004年营养与食品卫生学和卫生法学获国家级精品课程。
学院始终坚持对外开放，注重国际间的学术交流与合作，与加拿大、澳大利亚等国家和地区建立了友好合作关系，开展广泛的学术交流与科研合作。有10多位海内外知名学者被聘为学院博士生导师、名誉教授、客座教授等。
新世纪的第一个五年规划中，学院搬迁至新的教学办公大楼，拥有国内一流的工作环境和条件，将继续发扬“政治坚定、技术优良”的校风，团结进取，开拓创新，为建设国内一流、国际有影响的公共卫生学院而谱写新的篇章。
