与那国岛，隶属日本冲绳县八重山郡，地处北纬24°27′，东经123°00′，距离冲绳本岛西南509千米，距离东京2028千米，距离中国台湾省约110千米。据说在能见度极佳的情况下，自该岛可看到台湾省东部山脉。该岛也是日本距离我国台湾省最近的领土。
与那国岛是日本最西端的岛屿，岛上有称为与那国语的语言。
与那国岛东西长约12千米，南北约4千米，海岸线长27.49千米，面积28.88平方千米，其中森林和荒地面积16.74平方千米。岛上地形多山地和谷底，并有台地和湿地，岛中央偏东位置有宇良部山，海拔231.3米，是岛上最高点，岛西部有满田原山，主峰久部良峰，海拔188米。由于该岛上多小型河流，故有充足的淡水水源，在久部良峰西部还有若干池塘和湿地。值得一提的是，岛上有一种大型无毒蛇，最长可达2米多，多见于岛上平原湿地和丘陵地区。
该岛地质以砂岩和页岩为主，在岛的北部和中部分布有一定的石灰岩。岛的海岸线以断崖和岩石岸线为主，沙滩集中于岛的东北部、祖纳村附近、以及比川河口附近三处地点。
该岛附近海域水温较高，表层海水温度四季平均值为：冬季（1～3月，四季顺序与分划下同）24℃，春季（4～6月）26℃，夏季（7～9月）29℃，秋季（10～12月）26℃。100米深度海水温度分别为：22℃，23℃，24～25℃，23～23℃。
历史
与那国岛在上次冰河时期属于亚洲大陆的一部份。1510年被纳入琉球王国的支配之下。1879年随琉球王国一起被并入日本。1945年至1972年被美国统治，之后再被美国交给日本管治。
海底遗迹
与那国岛的海底遗迹包括了上一个冰河时期的遗迹、陆生动植物的遗迹以及钟乳石的遗迹。这些证据暗示海底的建筑遗迹可能有3000至10000年以上之久，可能是世界上最古老的。
与那国岛于1985年开始名声远播。探险者新嵩喜,八郎（あらたけ きはちろう）（英语：Kihachirō Aratake）偶然发现了非常奇特的、据说属于古文明的水下的建筑结构。历史及考古学在此之前对这些建筑结构的存在并不知情。之后没有多久，一群由琉球大学的木村政昭（きむら まさあき）（英语：Masaaki Kimura）指挥的科学家证实了这些遗迹的存在。