有肉芽组织逐渐取代血栓的过程，称为血栓机化。如果纤维蛋白溶解酶系统活性不足，血栓存在时间较长时则发生机化。在血栓形成后的1-2天已经开始有内皮细胞、成纤维细胞和成肌纤维细胞从血管壁长入血栓并逐渐取代血栓。