稀有种是指不是立即有绝灭危险但是存在于很有限的地区内，或虽有极大的分布范围但只是零星分布，很容易陷入濒危或绝灭的种类。我国在1989年出版的《中国珍稀植物》中列为稀有种的有110种，如水杉、珙桐、银杉、望天树、金花茶、银杏、鹅掌楸等等。一般泛指一些濒临灭绝，非常稀有的植物，动物或其他药材等等。