上海市中医医院创建于1954年，地处市中心北部区域芷江中路274号，在市中心石门一路67弄1号设有门诊部。是一所中医特色浓厚、临床科室齐全，医学人才济济，集医、教、研为一体的综合性三级甲等中医医院，是上海中医药大学非直属附属医院，并牵头与三所二级甲等中医医院合作建有“上海市中医医院医疗合作中心”。
上海市中医医院占地面积1.67万平方米，建筑面积3.33万平方米，其中业务用房2.45万平方米。主体建筑为设施先进的18层病房大楼，开放床位近500张，全院门急诊量超过3000人次/日，床位使用率在90%以上。医院有高级卫生技术人员90余人，拥有全国名老中医1人，医学博士16名，医学硕士39名。医院设有上海市名老中医诊疗所和上海市中医中西医结合专家诊疗所两个专家诊疗中心,云集张镜人、裘沛然、颜德馨等70余位代表上海中医界最高水平的专家为病人服务。
上海市中医医院有5个专科被列为上海市中医特色专科：中医失眠症特色专科、中医红斑狼疮特色专科、中医小儿厌食症特色专科、中西医结合治疗帕金森病特色专科、中医综合治疗腰椎间盘突出症特色专科；建有五个老中医工作室：王翘楚老中医工作室、沈丕安老中医工作室、董氏儿科王霞芳老中医工作室、李如奎老中医工作室、余莉芳老中医工作室。
近年来引进、更新了一批先进的现代化仪器设备，如DSA、螺旋CT、全自动生化仪、彩色超声仪等，为病人提供科学的诊断、治疗保障。
医院有博士生导师2人，硕士生导师20余人，承担上海中医药大学本科生和研究生的课堂及毕业实习教学任务，同时还承担全国和世界各地医生进修和培训任务。建院近50年来，有20余项科研成果分别获得全国中医药重大科技成果奖和部级中医药科学技术进步奖。
该院在《2007全国医院排名》中神经内科排名名列第八
