大成殿东西两侧的房子叫“两庑”，是后世供奉先贤先儒的地方这配享的贤儒大都是后世儒家学派中著名的人物，如董仲舒、韩愈、王阳明等。在唐朝仅有20余人，经过历代增添更换，到民国时，多达156人。这些配享的人原为画像，金代改为塑像，明成化年间一律改为写有名字的木制牌位，供奉在一座座的神龛中。现在两庑中陈列着历代石刻。
“老桧曾沾周雨露，断碑犹是汉文章”。东庑中保存着40余块汉、魏、隋、唐、宋、元时的碑刻，最为珍贵的是“汉魏北朝石刻”共22块。西汉石刻，首推“五凤”；东汉石刻，以“礼器”、“乙瑛”、“孔宙”、“史晨”碑为隶书珍品；北朝以“张猛龙”碑为魏体楷模。西庑内陈列的100多块“汉画像石刻”，也是久负盛名的艺术珍品。这些石刻，内容丰富，既有神话传说的青龙、白虎、朱雀、玄武，又有反映当时社会生活的捕捞、歌舞、杂技、行医、狩猎，是研究我国汉代社会生活的珍贵资料。石刻的技法，有的细致精巧，有的粗犷奔放，各具风格。两庑北部陈列的584块“玉虹楼石刻”，是清乾隆年间孔子后裔孔继涑收集了历代著名书法家的手迹临摹精刻而成的。这些石刻原被弃置在曲阜“十二府”的玉虹楼下，1951年移入孔庙，1964年装镶展出，供书法爱好者欣赏。
