概述
分类地位：小多孢菌科（Micropolysporaceae）是放线菌门、放线菌纲、放线菌亚纲、放线菌目的1科。
形态特征：在气生菌丝和（或）基内菌丝上形成不足20个孢子的短链。
主要属
本科现有5个属。
1、小多孢菌属：孢子直径1.2～1.5微米，在侧枝端基向形成；细胞壁化学组分Ⅳ型，即以内消旋二氨基庚二酸以及阿拉伯糖和半乳糖为特征组分；DNA（脱氧核糖核酸）中的G+C克分子含量为66.2～67.5％。常见于土壤、堆肥、干草和谷物中。干草小多孢菌是过敏性呼吸道感染“农民肺病”的病因之一。代表种为短链小多孢菌，分离自结核病患者的痰液中。
2、小双孢菌属：气生菌丝上产生成纵对的孢子，有或无柄，先形成蕾芽，后膨大，由横隔分开，逐渐形成两个球形或椭圆形的孢子。细胞壁组分Ⅲ型，代表种为玫瑰小双孢菌。
3、小四孢菌属：多数只在气生菌丝上形成4个孢子的短链，也有少于或多于4个孢子者，最多达6个；孢子丝先一分为二，顶端部分分裂为两个孢子，基部再分为4个孢子；细胞壁一般Ⅲ型，但青色小四孢菌和褐色小四孢菌的胞壁还含赖氨酸、甘氨酸、内消旋二氨基庚二酸和迹量的左旋二氨基庚二酸。代表种为青色小四孢菌。
4、马都拉放线菌属：气生菌丝上形成5～15个孢子的短链，有时含孢子较少或较多；孢子丝直、弯曲、环状至螺旋形，有时为粘物质所包，形成假孢囊；孢子球形、椭圆形，表面光滑或带疣，有的种有孢间垫；胞壁组分Ⅲ型，全细胞水解物含马都拉糖，有的种还含半乳糖，DNA中的G+C克分子含量为77.4％；能产生多种抗生素。代表种为马都拉放线菌。
5、卓孢菌属：在气生菌丝和基内菌丝上形成6～10个（有时达20个）孢子的短链，直、弯曲或螺旋形，孢子表面光滑或有小刺，含有为液泡所包围的中央体；细胞壁组分Ⅲ型，全细胞水解物含马都拉糖；分枝脂肪酸含量较高。代表种为绿藤黄卓孢菌。
