高头清真寺位于高头回族乡高头村西南隅，建于明朝嘉靖十九年（1541年），占地面积4567平方米。清乾隆、同治年间进行过两次规模较大的扩建。光绪二十八年(1902年)修葺时，大殿后节顶上加筑木楼，高约10米，木楼顶端安装有慈禧太后赏赐的琉璃宝瓶。（据说1900年八国联军入侵北京，慈禧太后和光绪皇帝仓皇出逃，途径昌平州西贯市，受到当地清真寺中乡老掌教菜万春等人的盛情款待。慈禧太后回宫后，念其“护驾”有功，特钦赐宝瓶给西贯村清真寺和高头清真寺。因为菜万春系高头人氏，故高头清真寺得此赏赐并得以从修。）1982年落地重修并对外开放。全寺由礼拜堂、南北讲堂、净浴室、殡仪室等部分组成，系当地穆斯林开展宗教活动的中心。
该清真寺坐西朝东。整个寺院气势宏伟，风格别致，建筑格局十分协调。是一座中国宫殿式和阿拉伯式建筑风格相结合的伊斯兰教清真寺。门楼高10米，上端镶嵌着“高头清真寺”五个楷书金字，四周是阿拉伯装饰风格的图案和饰纹大门两侧伫立一对石狮，显示了岁月的沧桑。主体礼拜寺，面积250平方米，可容500人的礼拜活动。大殿后节加筑高20米的木楼，殿顶雕刻和绘画沥粉贴金，金殿内柱14根，组成18个拱门，整个殿堂雕梁画栋，富丽堂皇，结构独特。大殿的两侧各有一幢石碑，用汉字和波斯文字记述着整个寺院的沿革过程。在木楼的顶端安装着慈禧太后和光绪皇帝钦赐的宝瓶。
附:高头清真寺碑文
盖自西域传教以来，讲求礼义叩拜，真主恒资寺之整齐、殿之森严，以表叩拜之虔诚。无如历年久远，木植砖瓦凋零，蔡老师文通尝欲复修而有志末远。不意事在万难之际，忽遇光绪皇帝西巡，过西贯市村，驻跸于清真寺。时有杨得青、李有泉、蔡万春数人迎驾有功，及皇帝还朝，恩赐黄顶，重修清真寺于此，因西贯市足夸耀于当时者也。未几，皇上又以万春系极邑高头人，即文通之子也，因赐七品顶戴、皇宝顶还家，重修高头清真寺，非当时之宠异、后世之光荣乎！?于是，杨得青、李有泉自备骡脚至此村，毫利不取，并为主上祐助，赴此佳会，同众议定先修正瑶，复修大厦。不幸其功未成，蔡老师文通呜呼哀哉。其子万春复任，照时样修成，非百年不逢之奇遇，千载宜传之盛典乎！？恐日久月深湮没不彰，爰泐琐氓以示永垂不朽云。(谨记，皇上西巡在光绪二十六年七月间，此时，蔡万春设教于西贯市清真寺，固得此恩荣。)
光绪三十一年岁次乙巳仲夏吉旦
