水生环境（Aquatic Environment）是指水生生物生存的外部环境介质。由流水和静水环境。前者如池塘、湖泊、沼泽、水库，后者如江河、溪流、泉水、沟渠。不同的水生环境理化性质不同。静水环境，水不流动，水中温度、气体及营养盐类分层、分带现象明显；而流水环境，水体流动，表底层混合较均匀，一般无明显分层现象。海、淡水水域盐分含量明显不同，水的渗透压差异很大。生活在不同的水环境中的生物群落结构和功能也有明显的不同，一般无特殊生理适应调节机能的咸淡水生物不能互换生存环境，否则会马上导致死亡。一方面水生环境为生物生长提供了丰富的水源，也可缓解大洪水对于生态系统的冲击等，这些因素对河流生态系统是有利的。