北京工商大学机械自动化学院是1999年在原北京轻工业学院机械工程系的基础上诞生的。1958年，北京轻工业学院组建时，机械工程系开始招收本科生，1981年开始招收硕士研究生。是目前北京市市属、市管院校中最早建立的机械设计及理论学科之一。经过几代人的共同努力，在全国机电行业中形成了较大的学术影响，为国家培养了大量的机电专业的应用型和复合型专门人才。
机械自动化学院的学科建设集中在硕士研究生和本科生两个层次，拥有机械设计及理论和机械制造及自动化两个硕士点。硕士研究生专业研究方向主要有：先进制造技术；机电设备检测与控制；汽车服务工程；先进复合材料构件设计、制造与应用；计算机辅助工程；机器人与仿生技术；先进传动技术及控制等。本科专业为机械工程及自动化，专业方向主要有：汽车电子工程、机械电子工程、机械制造及自动化(数控)、机械设计及自动化。
学院现有专任教师34名，正教授7名，副教授14名，博士后3名，博士13名，具有博士、硕士学位的教师占专任教师的85％；实验教师6名其中3人为硕士学历。学院拥有国家级优秀教师、北京市高校教学名师、北京市高校青年教师基本功比赛工科二等奖、北京市高校教师师德先进个人、北京市高校优秀德育工作者等，学院被评为北京市高校德育工作先进集体，学院党总支被评为北京市高校先进基层党组织。有多名教师获得学校多媒体教学一等奖、学校双语教学一等奖、学校青年教师基本功比赛工科一等奖等荣誉称号。学院现有全日制本科生760人，硕士研究生50人。
学院设7个学科部，即：汽车电子工程、机械电子工程、机械设计及自动化、机械制造及自动化、制图、力学、机械基础。
机械自动化学院近三年来承担和参与国家级、省部级科研项目25项，企业服务项目30余项，近年来发表科研和教学论文300余篇。
学院教学坚持以人才培养为根本，积极推进素质教育的同时加强学生的创新精神和实践能力的培养。每年有一批学生考取清华大学等重点大学的硕士和博士研究生，2004年本科毕业生就业率达到98.08％，2005年、2006年达到100%。
北京工商大学机械自动化学院于2008年11月18日调整为北京工商大学机械工程学院。
北京工商大学机械工程学院由原机械自动化学院、工科实践中心、数理系物理教研室和物理实验室合并组建而成。工科实践中心为机械工程学院的下属机构，承担学校相关的教学科研任务，对外可以保留北京工商大学工科实践中心名称。
机械工程学院下设机械工程系、工业工程系（筹）、物理教研室、工科实践中心。学院拥有机械工程及自动化、工业工程2个本科专业和机械设计及理论、机械制造及自动化2个硕士学位授权点，具有机械工程领域工程专业硕士学位授予权。
北京工商大学机械工程学院办学地点为阜成路东校区耕耘楼及配楼第四层、良乡校区工一楼、工科实践中心楼和良乡金工实习车间。
