传统的政务流程复杂且分散。由于以前的技术不能实现整个业务条块的联网，整个业务数据流程不得不按地理位置和人力分配被分割在多个部门，从一个部门转到另一个部门，增加了交接环节和复杂程度；在传统的业务流程中，相同的信息往往在不同的部门都要进行收集、存储、加工和管理，造成了大量重复劳动。
目前，虽然不少政府部门已经开展了电子申报和网上审批，但大多停留在用计算机系统去模仿传统的手工处理过程。随着电子政务的深入开展，不能简单地将现有政府事务原封不动地移到计算机上处理，必须对政府传统工作方式、方法、程序等进行重新审视，进行必要的清理、简化、优化、整合和改造。
政务流程再造(Government Process Reengineering，GPR) 运用现代公共行政学理论和信息技术手段，对政府部门的业务流程作根本性的思考和彻底重建，其目的是在办事效率、行政效能、行政成本、行政能力和公共服务等方面取得显著的进步，使得政府部门能最大限度地适应行政管理体制改革的要求。政务流程再造要把传统以政府职能为中心的行政模式转变为以政府客户为中心的行政模式，要以新公共管理理论和新公共服务理论倡导的价值体系为核心。
通过政务流程再造，可以确定每个政务流程应该采集的信息，并通过应用系统实现信息在整个流程上的共享使用。可以充分授予办事人员以权限，发挥每个公务员在业务流程中的作用。可以将传统业务流程的串联模式变成并联模式，提高办事效率。可以在变革中不断整合政府职能，不断提升政府绩效水平。根据国外实践经验，实施政务流程再造以后，政府部门的绩效水平可以提高40%到60%。
政务流程再造一个典型案例是美国印第安纳玻利斯市个人防盗报警系统的安装许可申请。美国印第安纳玻利斯市原来准备把安装个人防盗报警系统的安装许可申请流程原封不动地搬到网上去，但在该电子政务系统设计和认证过程中，有的专家指出这套申请程序本身存在低效、耗时等问题，建议由负责安装的公司向市政府注册。经过这样修改，整个个人防盗报警系统的安装许可申请流程环节减少了很多，公众的满意程度也得到了很大的提高。
政务流程再造的一般步骤如下：首先梳理政府部门的业务，对业务进行分类并划分层次；建立业务描述标准和业务流程图绘制标准，对每个业务进行描述并绘制相应的业务流程图。然后对办事人员和政府客户（企事业单位和个人）进行调查研究，征求他们对现有业务流程的意见；根据调研结果对业务流程进行分类，针对不同情况选择再造方法（如废除、简化、优化、合并等），绘制新的业务流程图。最后发布新的业务流程规范，对原工作流程、机构设置和人员编制进行调整，并建立配套的监督管理制度。
由于商务流程再造起步早，理论和方法相对成熟，政务流程再造可以借鉴商务流程再造的有关成果，制定政务流程再造相关标准规范，研制政务流程再造工具。
值得指出的是，政务流程再造必然会引起行政权力和部门利益的再分配，权力和部门利益之争将成为政务流程再造的强大阻力。高层官员和政府部门一把手一定要下定决心，坚持不懈地推进政务流程再造工作。值得庆幸的是，党中央、国务院历来高度重视行政管理体制改革，中国共产党第十七届中央委员会第二次全体会议提出了关于深化行政管理体制改革的若干意见。
