胚胎毒性是指外来化合物在无明显母体毒性的剂量时，对胚胎或胎儿产生的损害。胚胎毒性表明该物质可通过胎盘屏障影响胚胎或胎儿的发育。
胚胎毒性包括：
①胚胎死亡（子宫内死亡），在胚胎毒物的作用下，受精卵可能在未着床前死亡，或着床后胚胎发育到一定阶段就死亡，然后被吸收（早期死亡）或成为胚胎（晚期死亡）。
②畸形（malformation），指永久性的形态结构异常，包括外观、内脏和骨骼畸形。畸形起源于结构发育的偏差，有的畸形危及及机体生存（如脑小畸形或无脑畸形），有的只影响正常功能（如多趾、缺趾、兔唇等）。
③生长迟缓（growth retardation），能引起胚胎死亡和畸形的胚胎毒物多数能引起生长迟缓。局部性的生长迟缓可视为畸形（如小眼畸形）。
④功能不全（functional defects），包括生物化学、免疫学和中枢神经系统等的功能缺陷。功能不全在出生时常不被觉察，要在数月或更长时间后才显示出来。
