军医进修学院是一所以继续医学教育为基础、临床医学研究生教育为主体的新型院校，是国务院学位委员会首批批准具有博士、硕士学位授予权的单位之一，为全军培养高层次临床医学人才。1996年被批准为临床医学博士后流动站；2000年被批准为口腔医学博士后流动站；1998年被批准为全国首批开展临床医学博士、硕士专业学位试点单位。学院共有10个学科、19个专业招收博士研究生，21个学科、33个专业招收硕士研究。现有博士研究生导师89名、硕士研究生导师160名，每年招收研究生200余名、进修生1000余名，有实习生200余名。
医院具有良好的科研条件，每年承担国家和军队科研课题200余项。1980年以来，共获得国家、军队科技成果奖励1000余项。每年发表学术论文1600余篇。医院主办的《军医进修学院学报》，编辑出版的《中国医院感染学杂志》、《中华肝胆外科杂志》、《中国医学影像学杂志》、《中国激光医学杂志》8种被列为国家核心期刊。
医院与60多个国家和地区的医学院校、医疗科研单位开展了广泛的学术交流和技术合作，每年有400多名技术人员出国进修和技术合作，有400多名国外专家来院访问、讲学。先后聘请了180余名国外著名学者担任名誉教授和技术顾问。