派系政治是日本政党政治的最大特点。在派系政治下，同属一党的议员因为利益不同，以某个具有重要影响力的人物为核心，结成一个个具有一定组织形式的小团体。
一方面，派系议员需要派系领袖支持方能出任内阁要职并获得足够资源参选，不遵守派系决议的议员会受到派系领袖的惩罚，甚至成为政治生涯的障碍；另一方面，派系领袖必须得到足够的议员支持才能巩固自己的地位，为此他不仅会优先选拔本派系成员出任要职，还会培养有前途的新人。
在政治实践中，一些院外集团为了确保本团体的议员能够坐稳议席，或者让代表本集团利益的派系组阁，以支付大量金钱为代价，与强大的派系结成联盟，进行权钱交易。因此，派系政治近几年越来越成为了日本政治的一大痼疾。
在自民党内部，目前主要有以下几大派系：森派：名义是“清和政策研究会”；桥本派：以“平成研究会”为正式名称；江藤·龟井派：是由原先的渡边美智雄派的一部分和脱离三冢博派（森派前身）的龟井静香集团于1999年结成的派系；崛内派：由2000年从加藤派退出的古贺诚等人组成；山崎派：前身是河野一郎派—中曾根派—渡边美智雄派，渡边派分裂后，以山崎拓为首的部分成员成立了山崎派；加藤派及河野集团：加藤纮一于1998年继承了这一派别，但是以河野洋平为首的10名议员对此不满，退出该派，成立了河野集团（正式名称“大勇会”）。