职称:同济大学化学系 教授
简介: 同济大学化学系分析科学实验室的学术带头人,从事化学计量学(化学信息学)和生物信息学的基础理论研究,在波谱解析,高维数据处理和复杂体系分析等方面都创造了新的理论和算法。近年来,又在遗传算法和遗传编程等优化算法方面做了大量的研究和应用工作。最近,研究重点聚集在生物信息学,包括计算蛋白质组学、蛋白质结构预测、基因芯片数据处理、RNA剪切位点识别,HTH结构域识别,蛋白质相互作用组学和代谢组学等课题上,并取得了阶段性成果。
先后承担了7项国家自然科学基金项目:
模式识别在分析化学中的应用(1986-1989)
适应系统在化学计量学中的应用(1991-1993)
化学计量学高维数据分析的理论和方法(1994-1996)
遗传编程在化学计量学中的应用研究(1997-1999)
化学计量学在药物分子设计中的应用(2000-2002)
化学计量学在生物信息处理中的应用研究(2003-2006)
计算蛋白质组学研究(2007-2009)
目前研究课题有:蛋白质与药物分子对接,蛋白质与蛋白质对接,药物分子虚拟设计, AhR对接,基因芯片(microarray)数据处理,蛋白质二级、三级结构预测,RNA剪切位点和可变剪切位点的识别,DNA和蛋白质结合位点的识别,手性化合物的分离分析, 利用色谱保留时间提高蛋白质组学鉴定的质量,基因启动子的识别,helix-turn-helix和beta-turn识别,投影旋转新方法、三维非负矩阵分解,复杂样品的分离分析,相互作用组学以及代谢组学的数据处理等。
本课题组已发表论文百多篇,其中在Biochimie,Analytica Chimica Acta ,Talamta, Chemometrics & Intelligent Laboratory System, Computational Biology and Chemistry,Journal of Mathematical Chemistry,Journal of Molecular Structure: THEOCHEM等杂志上发表SCI论文40多篇。