内边界层又称次生边界性(secoudary boundany layer),是指气流从一种下垫面过渡到热力、动力性质不同的下垫面在原来边界层内产生的新边界层。分两种情况:①空气从一种粗糙度的地面上流动到另一种粗糙度的地面上,但地表的湍流热通量或气层稳定度不变。如图所示的内边界层自两种下垫面交界处开始,厚度随下风距离增大而增大。内边界层中的湍流特征和气象要素阔线已适应新的下垫面而上部仍旧保持原有边界层的特性,各种气象要素在内边界层顶上下有拐折现象,这就使得实际测定的气象要素阔线、湍流和扩散往往不能遵守简单的理论关系。在下垫面粗糙度差异大的过渡气流情况下大气扩散计算应合理地考虑扩散公式和扩散参数的变化。②热内边界层。气流从一种热力性质的下垫面进入另一种下垫面所产生的新的边界层。出现在海岸带或大湖沿岸的情形最典型,其中以气流自冷海(湖)面进入暖陆面的情形最有实际意义。