徐医附院前身是美国人1897年开办的徐州第一个西医诊所———福音诊所（后称“坤维医院”），1900年在其隔壁又建“博济医院”，后合并称为“徐州基督医院”；新中国成立后，于1951年正式接办医院，易名为“徐州市立第二医院”，1959年更名为“南京医学院徐州分院附属医院”，1960年8月“徐州医学院”正式挂牌，该院更名为“徐州医学院附属医院”。
徐医附院已有111年的悠久历史，坐落于两汉文化的发祥地、国家历史文化名城———徐州，是一所集医疗、教学、科研、保健、急救、康复等功能任务为一体的省属综合性医院、苏北地区唯一的一所卫生部颁三级甲等医院、国内首批卫生部国际紧急救援中心网络医院、国家级爱婴医院、首批全国百姓放心示范医院、江苏省骨髓移植定点医院。服务辐射苏、鲁、豫、皖四省接壤地区近20个地市、147个县区，约1.2亿人口。目前，医院建筑总面积8万平方米，实际开放床位1218张，年门诊量达100万人次，年出院病人4万余人次，日门诊量超过3000人次。
全院共有职工1535人，卫技人员中具有高级职称285人，具有博士学位47人，具有硕士学位190人，硕士学位以上人数占医师总数的50%。入选江苏省医学领军人才2人，江苏省医学重点人才5人，江苏省“333工程”培养对象19人，“省六大人才高峰”培养对象3人，被评为国家和省级有突出贡献的中青年专家8人，享受政府特殊津贴的专家18人。
徐医附院设有一级临床科室18个、二级临床科室33个、医技科室8个、设有病区30个和ICU、CCU、EICU、PICU病房，重症监护病房床位数共计26张；设有8个医疗中心（骨髓移植中心、血液净化中心、急救中心、泌尿碎石中心、整形激光美容中心、激光近视治疗中心、立体定向放射治疗中心、消化内镜中心），3个研究所（江苏省麻醉研究所、心血管病研究所、神经疾病研究所），1个中心实验室和7个临床实验室；医院现有国家级重点学科建设培育点1个、省临床医学中心培育点1个、省医学重点学科4个、省政府重点实验室1个、省“科教兴卫工程”重点学科（实验室）2个、省级临床重点专科9个、市级临床重点专科17个，8个临床、医技科室获得国家药物临床试验机构资格；现有博士生培养点4个、硕士学位授予点28个，所有临床医学学科均取得硕士学位授予权，是省卫生厅临床医师进修培
训基地。
目前，徐医附院拥有医疗仪器设备6597台（件），10万元以上仪器设备317台（件），医疗设备总值达2.35亿元。拥有3.0T核磁共振机（国内第三台装机）、16排螺旋CT机、INNOVA 4100大型数字化平板X光机（国内第二台装机）、SPECT-PET/ CT显像仪、头部伽玛刀、体部伽玛刀等多台（件）现代化的高科技大型医疗设备。2007年，医院耗资2000多万元购置了美国瓦里安医疗系统公司生产的Clinac 23EX数字化控制放射治疗直线加速器一套，新建了国内一流的加速器机房，使医院的肿瘤放射治疗工作再上新台阶。
“十五”以来，徐医附院开展具有国内先进水平（填补省内空白）的技术项目44项，引进和开展具有国际先进水平（填补国内空白或国内领先）的技术项目8项；获国家、省、市级科研课题63项，其中国家自然基金项目14项，省、部级科研课题28项；近5年在国内核心期刊及中国科技论文统计源期刊发表论文1490篇（年均发表论文近300篇），在国外医学杂志发表论文45篇，其中被SCI收录的论文36篇，出版教材、著作36部。
为更好地发挥学科、人才、技术优势，拓展医疗服务市场，2005年5月，徐医附院对原徐州市第五人民医院实施托管，将其更名为“徐州医学院附属医院西院”。按照“大专科、小综合”的发展思路，将西院逐步建成一所以骨科、创伤外科为主，立足徐州、面向淮海经济区的现代化专科医院。目前，西院开放床位150张，拥有徐州市最先进的层流手术室及先进的医疗设备，医院本部又派驻数十名内、外科专家坐镇西院，为西院各学科的建设与发展奠定了基础。
为进一步满足日益增长的就医需求，徐医附院从2005年起酝酿的《徐医附院病房综合楼基建工程项目》，2007年被市政府列为为民办实事的重点工程项目之一。该项目占地面积4900平方米，总建筑面积103816平方米，拟建成地上21层，地下3层。建成后，医院病床数将达到2000张，将大大缓解徐州及周边地区广大群众的“看病难、住院难”问题。
徐医附院将建设成为医德医风好、医疗技术高、广大患者信得过、医疗环境舒适、享誉淮海经济区的综合实力最强的大型综合性医院。至“十一五”末，医院建筑面积将达到18万平方米，年服务患者将达到150万人次，成为淮海经济区一颗璀璨的医疗明珠。
