山西省生物研究所创建于1958年，其前身为中国科学院山西分院生物研究所（1958.11—1962.6）、中国科学院华北生物所（1962.7—1965.12）、中国科学院遗传研究所分所（1966.1—1978.7），1978年8月改名为山西省生物研究所，隶属于山西省科技厅。生物所是以生物技术和生物工程的研究开发为重点的多学科、综合性科学研究机构，研究领域涉及生物医药、生物食品、脆弱生态环境治理、食品安全与生物安全等众多领域。
生物所现有职工80余人，专业技术人员占70%。拥有多名学术带头人，其中享有国家特殊津贴的专家10人，并与山西大学、山西农业大学共同培养硕士研究生。所内设有生物制药、植物与恢复生态、生物食品、生物化工四个专业研究室、山西省发酵工程及技术开发重点实验室、山西省发酵工程中试基地、山西省乳品发酵中试基地、食品与生物安全检测中心。
自20世纪90年代开始，生物所共承担5项国家重点科技攻关项目，2项国家自然科学基金项目，1项国家中小企业创新基金项目和近百项省级科研项目。
四十余年来，共出版学术著作（包括参编）58种，发表研究论文770篇，取得科研成果100项，其中发明专利4项。
主要成果：
D-异抗坏血酸钠间接发酵新菌种新工艺：国内实现产业化，产品产量世界排名第一。
VB2半合成生产工艺：国内实现产业化，创造经济价值上亿元。
酶法生产D-对羟基苯甘氨：发明了一菌两酶法生产D-对羟基苯甘氨酸的先进工艺，达到国际先进水平。
人重组组织因子制备凝血酶原时间测定试剂：应用重组技术生产凝血酶原时间测定试剂,填补了国内的空白。
安太堡露天煤矿废弃地复垦系统工程的研究与开发示范：产学研合作研究历时近二十年，达到国际先进水平。
《山西植物志》是山西植物资源的总和，是一部系统地研究和论述山西野生和习见栽培维管束植物的科学论著。
生物所进行食品检测、微生物菌种的选育，发酵工程生产工艺的设计与优化，生化产品、生物食品、生物农药的研制与开发，生物物质测定及无机元素的分析，城市生态和恢复生态规划及可行性报告编制，植物数据库的建立，野生植物鉴定和调查等服务。
