学校始建于1956年9月，原名为安徽省金寨第二初级中学，校址在汤家汇积善寺，1957年10月迁址到南溪镇，现名为金寨县南溪中学。现占地面积180余亩，建有教学楼、行政楼、科学馆、图书馆、教师公寓、现代化餐厅等。建筑面积为52000多平方米。学校教学设施齐全，图书室、阅览室、实验室、语音室、微机室、多媒体教室、400米标准运动场、校园网等一应俱全。现有在编教师132人，中学高级教师58人；中学一级教师49人。自聘教师26人；在校学生数达3900余人，是市级“文明单位”，省级“花园式学校”，是一所文化底蕴深厚、办学传统优良的市级示范高中。在半个多世纪的办学实践中，学校始终全面贯彻党的教育方针，坚持以人为本，为学生终身发展奠定基础，为国家培养了大批优秀人材；为高校输送了大批合格新生，尤其是恢复高考制度以来，学校本科上线人数一直遥居全市同类学校之首。1988年以来，累计达本科分数线人数为2500多人。有10多位同学先后夺得全县高考状元，教育教学成绩突出，深得社会、家长、学生的信赖，是皖西地区一所影响较大的学校。
1988年至1996年，初中各年级由1个班增至3个班，高中各年级由3个班增至4个班。截止1996年7月，学校有22个班级，在校学生数达1800余人，教职工为72人。校舍全部为平房，建筑面积为23000平方米左右。
1996年9月经县委、县政府决定，原南溪镇初级中学合并到南溪中学。初中部各年级由3个班增加到6个班，全校学生数2300余人，教职工为106人。学校兴建了一幢30个教室，面积为3800平方米的教学楼，并于1996年秋学期竣工使用。
自1998年起，学校高中部各年级增加到6个班，全校共38个教学班，在校学生2800余人。教育教学质量大幅度提高，兴建了科学馆、男、女生公寓、教工宿舍楼，学校开始争创市“示范高中”，并于1999年12月评估，2000年7月批准，2001年11月正式挂牌为“六安市示范性普通高中”。
2002年至今学校主要发展高中部，由各年级6个班发展到14个班。目前学校有48个教学班，其中初中7个班，高中41个班。办学条件得到了较大改善，并已初具规模，正在争创省级“示范高中”。
