甘孜州藏医院成立于1984年，是集藏医医疗、教学、科研、制药为一体的全民所有制综合性民族医院，是全州藏医药业务技术指导中心、四川省藏医医院制剂中心、藏医药人才培训、实习基地和甘孜州医保定点医院。
甘孜州藏医药研究所于1999年经甘孜州编委批准成立，与甘孜州藏医院实行两块牌子一套人马的体制。 科室设置有：院办公室、财务科、医务科、教务科、总务科、药剂科、门诊部、住院部等八个科室。临床科室设置有藏医内科、外科、妇科、胃病及肝胆、心脑血管疾病专科、药浴室、中医科、西医科。辅助科室开设有“B超”、“胃镜”、“心电图”室等科室。
甘孜州藏医院、甘孜州藏医药研究所在继承和发展藏医药学的工作中，运用藏医药学理论和临床实践在治疗胃、肠、肝胆、风湿、类风湿、心脑血管疾病和中风、瘫痪、糖尿病、肾病等方面具有独特的治疗方法和显著的临床疗效，深受广大患者的欢迎，治愈了大批的门诊和住院患者，年平均诊疗各类病人4万余人次。
在藏医药人才培养工作中，由医院派师资及办班，先后培养藏医大中专人才350余名，培训各类藏医技术人才400余名，为名老藏医药专家配备学术继承人，已培养出国家级藏医药学术经验继承人2人、省级10人。在科研工作中，挖掘整理了大量的藏医药古籍文献，并先后承担国家科研课题1项、四川省科研课题3项、甘孜州科研课题4项，研究开发的治疗类风湿疾病的国家中药三类新药“藏药然降多吉胶囊”，历经6年的研究已获国家药监局临床研究批文，现即将完成Ⅲ期临床试验工作。完成了“十五味黑药丸”、“八味蒂达丸”两种常用藏成药的剂型改造，并对母本藏药“仁青佐塔”中汞的作用特点和安全性进行了研究。
