甘肃省中医院始建于1953年，原名甘肃省人民政府卫生厅中医门诊部，1955年更名为甘肃省中医院门诊部，1956年12月正式命名为甘肃省中医院。医院已成为一所集中医医疗、教学、科研、预防、保健和急救为一体的大型综合性三级甲等中医院，是“全国百姓放心医院”、“全国卫生系统先进集体”，省、市、区医疗保险定点医院。
医院现有职工917名，其中，卫生专业技术人员795名，占职工总数的86.6％，副高级职称以上人员136名；博士研究生6名，硕士研究生64名；享受国务院政府特殊津贴专家7名，卫生部有突出贡献中青年专家1名，甘肃省名中医6名，省级优秀专家4名，省级“333科技人才”2名，“555创新人才”4名，厅级学术技术带头人15名，国家中医药管理局和省级老中医药专家学术经验继承工作指导老师17人，继承人53人。国家级中医药类学会理事以上、国家级中医药类学会分会副主委和省级学会副主任委员以上33人。
医院现有编制床位750张，开设有15个病区。医院设置40个临床科室，6个医技科室，83个专科专病门诊；设置临床科研研究所7个，研究中心1个；设置职能管理部门14个。拥有国家中医药管理局重点专科1个，重点专科建设单位2个，为国家中医药管理局中医医院中药制剂能力建设单位和全国骨科重点研究室建设单位；拥有省级临床医学重点学科5个，省级重点中医药专科4个，省级重点专科建设单位2个；拥有5个中医药科研二级实验室，1个中心基础实验室；拥有图书3.5万册。医院资产总值2亿元。
医院作为负责单位科研立项89项，其中国家级2项，省部级43项，市厅级44项；科研获奖50项，其中省级科技进步奖5项，地市级科技进步奖14项，省级以上中医药行业科技奖31项；发明专利3项；名老中医经验继承临床研究项目7项；出版专业论著30部，在省级以上专业学术期刊发表论文1120篇。
医院先后被评为“全国卫生系统先进集体”，“全国百姓放心示范医院”、“甘肃省医院管理先进集体”，“全国青年文明号信用建设示范创建单位”，“甘肃省非典型肺炎防治工作先进集体”，“甘肃省诚信建设示范单位”，“兰州市园林化标兵单位”等荣誉称号，医院急诊科被卫生部、共青团中央授予“全国青年文明号”。
