南京农业大学信息科学技术学院成立于2002年，起源于1980年南京农业大学创办的计算中心和1985年成立的图书情报系。学院现有教职工47人，其中教授5人，副教授12人，博士生导师1人，硕士生导师6人，兼职教授4人，兼职硕士生导师7人。学院现下设两个系、两个中心：计算机科学与技术系、信息管理系、计算中心（计算机与信息技术教学实验中心）、软件工程中心。计算机科学与技术、信息管理与信息系统两个本科专业面向全国招生。学院现有3个硕士学科点：情报学、图书馆学和计算机应用技术。现各类在校生1000多人。
学院承担着全校学生的计算机公共课教学、该院的计算机科学与技术专业、信息管理与信息系统专业的教学任务。信息管理与信息系统专业已有二十多年的历史。经过发展，学院已由八十年代中期单一的本科专业发展为研究生、本科生相结合的专业教育体系。累计为国家培养出本科毕业生1000多人，硕士毕业生数十人。
信息科学技术学院拥有一支基础理论扎实、实践能力强、知识结构合理的教学、科研队伍。学院教师先后主持国家社科基金4项，主持和参加国家863项目2项，省厅局级项目多项。其中，主持国家“863”计划项目“棉花种子分子设计的生物信息数据库建设”，主持国家社科基金“网络环境下基于需求的地区信息资源共享系统评价研究”等。“中国分类主题词表”获国家优秀科技信息成果二等奖及国家社会科学基金项目优秀成果二等奖；“江苏科技信息网络中心建设”获省科技进步二等奖；为农业部畜牧司全国畜牧兽医总站开发的基于Internet的“全国种公牛站管理信息系统”，在全国各种公牛站推广使用。近年来，学院教师主编或参编专著和教材二十多部，其中较有影响的有：《汉语主题词表（第5卷）》、《文献分类法主题法导论》、《索引技术和索引标准》、《VB程序设计教程》、《大学信息技术基础》、《计算机网络技术与应用》等。在《计算机科学》、《计算机工程》、《中国图书馆学报》《大学图书馆学报》、《情报学报》等国内外专业核心期刊发表科研论文百余篇。
学院办学条件不断改善，计算机与信息技术教学实验中心下设计算机硬件实验室、网络实验室、多媒体实验室、信息组织实验室、软件实验室、计算机公共教学实验室等。学院仪器设备总值600多万元，计算机以及实验设备数量达900余台（套），为学生的实践教学环节提供了良好的环境和必要的保障。
在学生培养工作中，全面贯彻“以人为本”的办学理念，以学生成才为中心，以素质教育为主线，以培养学生创新精神和实践能力为重点，把专业教育、品德教育、专业基本技能的培养和训练紧密结合起来。特别是一系列“提增”活动的开展，增强了学生适应社会的能力，提高了学生选择职业的竞争力。近几年该院数十名本科毕业生被浙江大学、同济大学、大连理工大学、东南大学、南京航空航天大学、中国科学院等全国知名大学或研究院（所）免试录取攻读硕士学位，毕业生就业率达到95％以上，受到用人单位的欢迎。
学院目前已经形成了在情报学、图书馆学、数据库、网络技术、多媒体技术、模式识别与专家系统等多个方向发展，教学与科研开发并重的发展局面。为适应21世纪科学技术和经济发展对人才知识、素质、能力的要求，学院将加大教学改革力度，加强学科和师资队伍建设，全面提高教学质量，为我国社会主义现代化培养合格人才。
