西南林学院保护生物学学院（Faculty of Conservation Biology, FCB）以森林健康、生物多样性保护和生态安全为主要研究领域和学科特色。从事有害生物综合治理，森林、园林园艺、花卉、草坪等植物的病虫害防治，森林植物检疫，生物与仿生农药的开发研制，消防工程（包括森林消防和城市消防），野生动物及濒危物种保护，动物损害控制，自然保护区综合科学考察与规划管理，生物多样性保护及公众意识教育等方面的人才培养和科研工作。
保护生物学学院拥有森林保护学、野生动植物保护与利用两个省级重点学科，云南省高校森林灾害预警与控制重点实验室、中央与地方共建的森林保护学综合实验室、动物学综合实验室和消防工程综合实验室，以及野生动物、昆虫、森林病理与真菌标本室。拥有五个本科专业：森林资源保护与游憩（森林保护）、植物保护、野生动物与自然保护区管理、动物科学、消防工程；三个硕士授权点：森林保护学、野生动植物保护与利用和动物学。森林资源保护与游憩（森林保护）为省级重点专业，《自然保护区管理》为省级一类精品课程。目前在读研究生113人，本科生900余人。至2007年，已培养本专科毕业生2100余名，硕士研究生110余名，博士研究生2名。
学院现有教职工68名，其中教授16名，副教授27名，高级实验师1名。外聘博士生导师3名，硕士研究生导师42名；具有博士学位教师19名，硕士学位教师31名。
学院教师目前主持的在研课题45项，其中国家自然科学基金项目5项，“十一五”国家科技基础条件平台建设专项1项，教育部人文社会科学研究项目1项，国家林业局项目1项，云南省自然科学基金项目1项，云南省攻关项目1项，云南省教育厅科研项目7项，云南省林业厅项5项，西南生物多样性保育国家林业局重点实验室项目3项，昆明市科技局项目2项，横向课题11项，学校重点和面上项目7项。近三年来，学院教师在各级各类刊物上发表论文论著200余篇，其中SCI论文15篇。另外，保护生物学学院在自然保护区综合考察、生物多样性保护和自然保护区管理人员培训方面做了大量工作，取得了可喜的成绩。
保护生物学学院力求以特色立足，注重提高教学质量，突出应用性，加强学生的适应能力和发展能力的培养，服务地方经济和产业需求，促进森林健康，保护生物多样性和生态安全。
