位于原县治西北，明洪武三年(公元1370年)知县邱思齐建。明弘治七年(公元1494年)沔池人张守和尝修葺之。明嘉靖三十五年(公元1556年)高陵人王以明做县令时又重修。建新殿厦五楹，香亭一座，假山三峰，望石二柱，二司门狮二座，整饬正寝二殿，广癍一祠，各门甬道之类皆补葺焕然。又以门外车马之行直突神祠，虞其亵也，遂于门外建屏壁一座。又建鼓楼一楹。工兴於嘉靖丙辰正月之吉落成。至清嘉庆年间，改建为正殿五楹，寝宫三楹，东廓七楹，西廓七楹，前为戟门，门前有戏楼，向阳三门。
1926年，庙中神像曾被毁，后又修复。正殿供城隍，后殿及东西两廓房均塑有司之神。后神像全部搬除。
抗日战争期间，抗日民主政府曾在这里举办全县小学教师训练班。肥城解放前后，人民政府先后在这里开办多期师范讲习班。
建国后，庙中殿堂先后拆除，建起肥城最早的完全小学，70年代改办城关初级中学，直至1993年学校南迁井楼居民小区，城隍庙灭迹。