灭活是指用物理或化学手段杀死病毒、细菌等，但是不损害它们体内有用抗原的方法。
灭活病毒，会使病毒蛋白的高级结构受到破坏，蛋白不再有生理活性，所以失去感染，致病和繁殖能力，但是常规的灭活不影响病毒蛋白的一级结构，意思就是病毒蛋白的序列没有变化。
免疫系统对抗原的识别分成两种，一种是构像表位，一种是线性表位。构象表位意思就是蛋白的三维结构，而线性表位就是蛋白的序列一级结构。T细胞只需要识别线性表位就成接受免疫呈递细胞给出的信号，引发免疫反应。
所以灭活的病毒具有抗原性，但失去感染力。这个其实是很多疫苗的制造原理。
狂犬疫苗中的病毒是用β-丙内酯(BPL)灭活的
β-丙内酯(BPL)直接与病毒核酸作用，改变病毒核酸结构达到灭活目的.
甲醛也有灭活功能