中国农业大学理学院成立于2002年8月27日，由中国农业大学原应用化学学院、原工程基础科学部、原信息学院应用物理系普通组和计算机科学技术系数学组组成，分布在东、西两个校区。
目前理学院下设四个科系：应用化学系、应用力学系，应用数学系和应用物理系，有应用化学、应用力学、应用数学3个研究所。设应用化学和工程力学两个本科专业；具有硕士学位授予点7个： 农药学、农产品安全、分析化学、有机化学、固体力学、应用数学、运筹与管理；具有博士学位授予3个： 农药学、农产品安全、运筹于管理；与其他单位合办硕士授予点2个：生物物理、结构工程；合办博士授予点1个：车辆工程；设农药学博士后流动站1个； 国家“211工程”重点重点建设学科（农药学 ）1个；农业部重点开放实验室1个；农业部农产品质量检验测试中心1个。学院现有本科生350人左右，硕士研究生120人，博士研究生60人。
理学院师资力量雄厚，结构合理。目前全院有教职工152人，其中教授24人，副教授58人，具有博士学位的教师28人，客座教授1人。学院承担面向全校学生的数学、物理、化学和力学基础理论课的教学以及教学人才的培养任务的同时，还承担了国家科技攻关、国家自然科学基金、973、863计划及省部级和地方横向科研项目，取得丰硕的成果，多次获国家和省部级奖励；SCI论文在学校名列前茅，受到学校奖励。2002年全院共发表SCI、EI论文29篇，并获得多项科技专利、教学和科研成果奖励。农业部农药化学应用与技术重点开放实验室在2002的评估中，被农业部评为优秀重点实验室。
学院注重国内外合作与交流，经常选派教师出国进修或者进行合作研究，并邀请外国专家来学院讲学。每年接受国内外访问学者、进修人员及时性研究人员上百人，与美国、英国、日本、德国等国家的大学及联合国粮农组织（FAO）等多个知名的国际机构有着密切的学术和信息交流关系。
