组建于1994年4月。2002年原三峡办、移民开发局、监察局合并为国务院三峡工程建设委员会办公室后，更名为国务院三峡工程建设委员会办公室培训中心，是三峡办直属事业单位。
培训中心主要职能是：负责组织三峡库区有关县、处级以上移民管理干部和移民系统关键岗位人员的培训；负责组织三峡库区省、地、县三级移民部门开展移民培训工作；负责监督和指导三峡库区开展移民技能培训工作；协助办有关业务部门加强和监督移民培训经费的使用和管理工作；负责制订和下达三峡库区开展移民培训工作调研，为领导和机关提供决策依据；完成领导交办的其他有关工作事宜。2002年10月，在原有职能的基础上，增加负责办机关有关信息系统网络建设和服务管理工作的职能，中心正式开始对国务院三峡工程建设委员会政府网站进行筹建。
中心自成立以来截止到目前，共举办移民管理干部培训班29期，培训各级各类移民干部1400多人次，内容涉及移民政策法规、移民资金管理、移民规划管理、移民工程监理、移民外迁管理、移民档案管理、移民工程稽察和招商引资、地质灾害防治，淹没搬迁企业结构调整，以及移民局长综合素质培训等；协调督导库区省、市、县三级举办各类移民干部培训班386期，累计培训各级移民干部和专业人员达1.9万人次；规划指导库区基层开展移民技能培训达1 3万人次。