福州闽江口湿地西起福州的侯官，一直到长乐的梅花镇。专家已发现6块面积超过3000亩的大片湿地，分别是鳝鱼滩、马杭洲及其毗邻的滩洲（道庆洲、草洲）、蝙蝠洲、浮岐洲、浦下洲、新垱洲等，它们既是目前福建全省最大湿地，也是亚太地区候鸟迁徒途中重要的一处落脚站。由于有着充沛的闽江水来源，每年都有上千万只的越冬候鸟飞临此地栖息，朱鹮也一度停驻于此（五年前我曾与鸟会一道来此观鸟，一行白鹭从漠漠水田上飞过的景象令我为之震撼），其地理位置优势，属近自然湿地，是东亚——澳大利亚鸟类迁飞路线，具有一定的代表性和稀有性，支持着易危、濒危或极度濒危物种或者受威胁的生态群落，定期栖息有2万只以上的水禽， 定期栖息有多种（黑脸琵鹭、黑嘴端凤头燕鸥、鸿雁、白腰杓鹬、翘嘴鹬、红颈滨鹬、卷羽鹈鹕等）水禽物种或亚种的种群达到全球数量1％的个体，同时它也是中华鲟的栖息地，其它鱼类的一个重要食物基地、洄游鱼类依赖的产卵场、育幼场和洄游路线。闽江口湿地拥有丰富的野生动植物资源及多样的植被类型，在生物多样性方面同样具有十分重要的意义。
闽江河口段水量充沛，是鱼、虾、蟹及贝类良好的生长及繁殖场所，湿地上芳草萋萋，鱼翔浅底。然而近年来，由于闽江河口段湿地不断减少，以及污染加剧，导致水生动物资源量不断减少。
淘江流经闽侯县祥谦镇，是闽江下游南港的一个支流，这里生长着福建独有的淡水单脚蛏，1979年被确认为世界新种。
在闽江河口段的湿地上，生长着禾本科、菊科、灯心草科等植物80多种，浮游生物100多种以及40多种鱼类、虾蟹、贝类资源。这些生物都有各自去除污染的功能，在消除闽江水质污染中发挥着重要作用。特别是生长在湿地的植物，很多种都有吸纳重金属的特性，比如淡水葫芦、咸草、灯芯草等，对降解污染起非常独特作用。省环保局自然生态保护处工程师张少杨指出，闽江福州段流入的污水现在主要依靠湿地来净化，它相当于一个非常大的污水处理厂。
