2005年7月，Microsoft推出了用于AMD64（x86-64）以及安腾2平台的64位版本的Windows Server 2003 x64版。
Windows Server 2003 x64 版本支持基于 x86 指令集 (x86-64) 的 64 位扩展的体系结构，该体系结构既支持 AMD64 处理器，也支持采用扩展内存 64 位技术 (EM64T) 的 Intel 处理器。
Windows Server 2003 64 位版本设计为在高性能的 64 位处理器上运行，这样可以通过下列手段提高性能和可伸缩性：
• 每个时钟周期可处理更多的数据
• 不再有内存分页的限制，寻址更多的内存（大于4G）
• 数字计算运行更快
如果工作负载对内存或计算要求很高，则性能和可伸缩性优点通常会非常明显。例如：
• 可以将大型数据集整个加载到内存中，而不会降低磁盘访问速度。
• 在 32 位系统上需要数小时才能完成的复杂计算只需要数分钟即可完成。
• 过去要求使用大型服务器场的工作负载，现在可以部署在一台服务器上。
在基于amd64平台上（x86-64），此版操作系统会通过SysWOW64来支持以前基于32位windows应用程序。
当然也会有一些兼容问题。比如驱动程序、输入法和其它一些特殊应用程序。
SysWOW64模拟下，32位应用程序执行效率相比在纯32位操作系统下只高不低。
同时，在64位应用程序逐渐大量开发和主流大内存当道的趋势下，64位windows的价值日益昭显。
在专业领域，64位的应用下，工作效率相对于32位平台下有着明显的提升。
个人PC应用环境下，硬盘、内存占用相对稍显臃肿，还有一些软件的兼容问题。推荐有一定基础的朋友使用。