皖南医学院图书馆建于1972年，前身是芜湖医学专科学校图书室，现在的图书馆大楼启用于2007年，馆舍总面积27010平方米，阅览座位1646个。
图书馆现有工作人员24人，其中大专以上学历19人，高级职称5人，中级职称8人，初级职称4人。部门设有办公室、采编组、流通组、期刊组。
作为学校的文献信息中心，随着学校办学规模的扩大，新办专业的增加，图书馆不断充实完善馆藏文献的数量和结构。目前，馆藏文献达到102.54万册，其中，纸质文献39.67万册，电子图书62.87万册，中文报纸70种。同时，拥有多个文摘型或全文型数据库，并建立了镜像站点，初步形成了以医药卫生为主，纸质文献与电子文献互补的馆藏文献体系。
1999年，图书馆建成了图书集成管理系统局域网，先后采用金盘图书馆集成管理系统和汇文文献信息服务系统，图书馆的行政、业务工作，读者借阅及信息查询均实现了计算机网络化管理。
2003年图书馆建有48个座位的多媒体电子阅览室，建成了界面友好、内容丰富的图书馆主页。随着局域网网络的升级，网络设备的增加，网络24小时的开放，读者不仅能充分利用图书馆的文献资源，还能方便地查找互联网上的大量信息。
图书馆秉承以人为本，服务至上的宗旨，竭诚为广大读者服务，除了提供馆内阅览、图书外借、信息咨询、科技查新、计算机光盘和网络数据库检索、文献传递、文献复印外，同时承担对全校师生的医学文献检索与利用教学和对新生开展利用图书馆教育。