敦煌市中医医院始建于1983年9月，占地面积5131.7平方米，总建筑面积7392平方米，医院开放病床60张。全院现有正式职工85人，中医药护人员中卫技人员总数的70%以上，开设有内、外、妇、儿等12个一级临床科室和10个专病门诊，其中肛肠科为重点中医专科，配备有300MAX光机、B超、半自动生化分析仪等诊断治疗设备。
1996年门诊人次7.1万收治住院病人1100人次，年业务收入260万元，连续两年被评为全市卫生系统先进集体和市级模范文明单位，并被市委、市政府列为文明示范窗口单位，1994年该院被列为全省中医医院分级管理试点单位，1996年率先在全省达到“二级甲等中医院”标准。