生物模型数据库

王朝百科·作者佚名  2010-06-08
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BioModels Database是一个完全免费的,用来存储和交流数量型生物模型的数据库。 当前生物模型数据库得到自然出版集团(Nature Publishing Group)和PLoS的推荐和支持.

BioModels Database是一个免费的生物模型在线数据库。数据库中主要存储数量型生物化学模型。所有的模型都是在相关的科学文章中发表过的并且经过了同行评审。

所有BioModels Database中的模型都是已经发表在各种学术刊物上的,并且被验证人员用模拟软件模拟验证过的. 所有模型中的元素都被连接到相关参考数据库,方便用户快速获得相关详细信息。

生物学家可以以SBML和CellML两种格式上传生物模型。当模型上传后,会自动转换为以下格式供生物学家下载使用:SBML, CellML, XPP, SciLab, BioPAX和一些图形格式, 如GIF, SVG和applet.

BioModels Database由以下机构合作开发:位于英国剑桥的欧洲生物信息研究所(EBI)的运算神经生物学组(Computational Neurobiology Group); 美国加利福尼亚Keck Graduate Institute的SBML组和日本Systems Biology Institute以及 JWS Online, Stellenbosch University, ZA.

 
 
 
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