又名《珍本医书集成》,共收古今医书九十种，具有十分重要的学术与文献价值。本书将九十种医籍分隶十二类，即医经、本草、脉学、伤寒、通治、内科、外科、妇科、儿科、方书、医案、杂著。这种分类既符合中医的学术特点，又便于后人对中医理法方药的学习与掌握。
本丛书整理、汇编了上至黄帝下至民国五千年中华历代著名医学典籍210种，系中华中医经典之汇萃，其出版篇幅在中医历史上规模最大。丛书按中医学分为17类，涵盖了现代中医学的全部学科。各类之下，均全文收录能代表该类学术成就的典籍。为方便现代读者阅读，全书改古籍的竖排、繁体为横排、简体，增加新式标点，在保证底本原貌的情况下，对原书讹误之处进行校正。每章前对该书的整理进行了说明。该丛书兼目录学与丛书双重功能，是一套中医学的百科全书。
第1册
医经类
素问、灵枢经、难经本义、类经、内经知要
第2册
伤寒类
伤寒论、类证活人书、注解伤寒论、伤寒明理论、伤寒论注、伤寒贯珠集、长沙方歌括
金匮类
金匮要略方论、金匮方论衍义、金匮要略心典、金匮方歌括
第3册
温病类
瘟疫论、痧胀玉衡、广瘟疫论、外感温热病、疫诊一得、温病条辨、温热经纬、随息居重订、霍乱论、六因条辨、伤寒瘟疫条辨、时病论
第4册
诊断类
脉经、濒湖脉学、诊家正眼、脉诀汇辨、四诊抉微、三指禅、望诊遵经、察舌辨症心法、辨舌指南
第5册
本草类1
神农本草经、雷公炮炙论、珍珠囊补遗药性赋、汤液本草、本草备要、得配本草、本草纲目拾遗
第6册
本草类2
本草纲目（一）
第7册
本草类3
本草纲目（二）
第8册
方书类1
肘後备急方、备急千金要方、太平惠民和剂局方、普济本事方、济生方
第9册
方书类2
世医得效方、医方考、名医方论、医方集解、重校汤头歌诀、串雅内编、串雅外编、串雅补
第10册
内科类1
素问玄机原病式、宣明方论、内外伤辨、脾胃论、兰室秘藏、医学发明、阴证略例、十药神书、内科摘要、杂病论治准绳
第11册
内科类2
济阳纲目
第12册
内科类3
痰火点雪、症因脉治、理虚元鉴、傅青主男科、金匮翼、风劳臌膈四大证治、医醇胜义、血证论、中风斠诠
第13册
外科类1
刘涓子鬼遗方、卫济宝书、外科精要、外科精义、外科理例、解围元薮、疮疡经验全书、外科启玄、外科正宗、霉疮秘录
第14册
外科类2
洞天奥旨、外科证治全生集、疡科心得集、外科真诠、疡科纲要
伤科类
理伤续断方、跌打损伤妙方、正体类要、伤科汇纂、伤科补要、救伤秘旨、救伤秘旨续刻、伤科大成
第15册
妇科类
女科万金方、卫生家宝产科备要、妇人大全良方、济阴纲目、陈素庵妇科补解、傅青主女科、达生编、妇科玉尺、女科要旨
第16册
儿科类
小儿药证直诀、小儿斑疹备急方论、婴童百问、幼科发挥、幼科铁镜、幼幼集成、幼科释谜、遂生编、福幼编
第17册
五官科类
原机启微、银海精微、秘传眼科龙木论、审视瑶函、目经大成、咽喉脉证通论、重楼玉钥、白喉全生集、口齿类要
第18册
针灸类
针灸甲乙经、铜人腧穴针灸图经、子午流注针经、针灸资生经、十四经发挥、针灸聚英、奇经八脉考、针灸大成、厘正按摩要术
第19册
养生类
十问、合阴阳、天下至道谈、素女经、养性延命录、新刻奉亲养老书、三元参赞延寿书、养生类要、饮膳正要、遵生八笺、内功图说
第20册
医论医话
格致余论、局方发挥、医经溯洄集
医案类1
推求师意、医贯、医旨绪余、质疑录、医学真传、医学读书记、医学源流论、重庆堂随笔、冷庐医话、医原、存存斋医话稿、西溪书屋夜话录、名医类案
第21册
医论医话
寓意草、临证指南医案、古今医案按
医案类2
清代名医医案精华
第22册
综合类1
诸病源候论、华氏中藏经、三因极一、病症方论、医学启源、洁古家珍、儒门事亲、洗冤集录、卫生宝鉴
第23册
综合类2
此事难知、丹溪心法、脉因证治、玉机微义、证治要诀及类方、名医杂著
第24册
综合类3
医学纲目
第25册
综合类4
医学正传、韩氏医通、赤水玄珠
第26册
综合类5
医学入门、古今医鉴
第27册
综合类6
万病回春、先醒儒医学广笔记、医宗必读、医门法律、增补病机沙篆、证治汇补
第28册
综合类7
景岳全书
第29册
综合类8
石室秘录、辨证录、张氏医通
第30册
综合类9
医学心悟、医方一盘珠、医碥、兰台轨范、医林改错
第31册
综合类10
医宗金鉴
第32册
综合类11
杂病源流犀烛、类证治裁
第33册
综合类12
医学三字经、理瀹骈文、医学衷中参西录
