哈佛系统在内环骨板层和外环骨板层之间，是骨干密质骨的主要部分，由许多骨单位(osteon)构成。
骨单位为厚壁的圆筒状结构，与骨干的长轴呈平行排列，中央有一条细管称哈佛管。围绕哈佛管有5～20层骨板呈同心圆排列，宛如层层套入的管鞘，哈佛管与其周围的骨板层共同组成骨单位，亦称作哈佛系统。Clopton Havers 于1691年最早确定了密质骨结构，并把密质骨的基本结构单位命名为哈佛系统。因为他当时没有叙述围绕血管呈同心圆排列的骨板，后来一些作者根据同心圆排列的骨板，又命名为骨单位。无数的骨小管(canaliculi)呈放射状，从哈佛管向骨陷窝走行，使哈佛管与陷窝相通。其功能是使陷窝内的骨细胞经骨小管获得营养液，同时将代谢产物排出。陷窝是扁形或椭圆形结构，其内壁有无数小裂隙，与骨小管相通，骨细胞的许多细长的突起，经裂隙伸入骨小管内。每一骨单位的表面有一层粘合质，呈强嗜碱性，含有大量的骨盐，但胶原很少。在横断面的骨磨片上呈折光较强的骨单位轮廓线，称为粘合线(cementing line)。在骨单位之间，充填着一些不完整的骨单位，形状不甚规则，大部分缺乏哈佛管，称为间骨板(interstitial lamellae)，是部分吸收后的骨单位，也是旧有的骨单位遗迹。哈佛管的直径平均为300μm，大约3～5mm长，内壁衬附一层结缔组织，其中的细胞成分随着每一骨单位的活动状态而各有不同，在新生的骨质内多为成骨细胞，被破坏的骨单位则有破骨细胞。一般的骨单位为梭形细胞，许多较早期的骨单位，特别是新生儿的皮质骨，缺乏环形排列的同心圆骨板层。骨沉积在骨外膜或骨内膜沟的表面形成的骨单位，或在松质骨格内形成的骨单位，称为原发性骨单位(primary osteon)。哈佛管被易变的延长了的同心圆骨板柱围绕，仅有几层骨板。原发性骨单位常见于幼骨，特别是胚胎骨和婴儿骨。随着年龄增长，原发性骨单位也相应减少。继发性骨单位(secondary osteon)与原发性骨单位相似，但是由原发性骨单位改建后形成。继发性骨单位，又称继发性哈佛系统，因为有一粘合线，很容易辨认，并使其与邻近的矿质化组织分开来。
哈佛系统是成熟密质骨，有成人密质骨的显著特征。在初生时，仅在人骨的股骨中段出现，日后在所有长骨逐渐形成。虽然呈纵向走行，但常有许多分支互相间形成广泛吻合。哈佛管内有小血管，仅有单条的大都为毛细血管，有时可见到两条，为小动脉或小静脉。伏克曼管与哈佛管走向相互垂直，并彼此相通，因此，其中的血管也彼此交通。在哈佛管内还可见到细的神经纤维，与血管伴行，大都属于无髓神经纤维，但偶尔可见到有髓神经纤维。这些神经主要由分布在骨外膜的神经纤维构成，从其粗细可表明，即含有节后交感神经纤维，也含有细的无髓痛觉传入纤维。
