《湖南农业大学学报》（自然科学版）于1956年创刊，系美国CA、俄罗斯AJ、英国CABI、日本JST、中国CSCD、中国生物学文摘、中国农业文摘来源期刊和中国学术期刊（光盘版）、中国期刊网、“万方”、“维普”等全文上网数据库收录期刊；中文核心期刊、中国科技核心期刊、中国农业核心期刊、中国期刊方阵“双百”期刊。1995年以来，在国家和省部级评奖活动中共获得各种奖励16项。其中两次荣获国家教育部优秀科技期刊一等奖，两次荣获湖南省“十佳”科技期刊，连续5次被评为湖南省一级期刊，2006年被评为中国高校精品科技期刊。
《湖南农业大学学报》（社会科学版）于1999年创刊，系中国期刊网、中文科技期刊数据库、万方、维普数据——数字化期刊群的来源期刊，中国核心期刊（遴选）数据库收录期刊，CAJ ——CD规范执行优秀期刊。先后在全国“首届农林高校社科优秀期刊评比”中被评为优秀期刊，在教育部社科司和中国人文社科学报学会“第三届全国社科学报评比”中被评为全国优秀社科学报。