吉林大学图书馆医学馆前身即原白求恩医科大学图书馆，是中国高等学校中专业特色较强的生物医学专业图书馆。本馆始建于1942年，迄今已走过了62个春秋。几十年来， 医学馆跟随学校几经整编、更名和迁址，现馆舍建于1985年，建筑面积8400m坐落在春城美丽的新民大街上。 吉林大学图书馆医学馆是一所以生物及医药卫生专业为藏书主体的高校图书馆，全馆现有工作人员38人，其中研究馆员1人，副研究馆员8人,馆员20人,助理馆员3人,管理员6人。大专以上学历占92.5%。内设有馆长室、办公室、期刊部、流通阅览部、文献检索室、计算机室等业务部门。为方便读者，各阅览室和书库均实行全方位的开架服务。周开放时间达98小时。
医学馆共有参考阅览室6个，包括：现刊阅览室、过刊阅览室、哲学社会科学阅览室、学生阅览室、教师阅览室、文献检索阅览室， 共设阅览室坐位186个；书库5层，可容纳中外文图书、期刊39万余册；电子阅览室2个，拥有164个机座，可向用户提供网络、光盘等电子信息的检索和咨询服务。
医学馆馆藏文献种类齐全，包括中外文图书、期刊、报纸、本校 区博士和硕士论文、音像资料、多媒体光盘、各类数据库、中外文电子期刊等，形成了一套以生物医学文献为主体，兼有人文、社会科学文献的多种类型、多种载体的馆藏体系。其中特藏文献中，收藏中医古籍、经史子集、日本版古医书近7000册。有许多属于明代、清代的精刻本和抄本。像《注解伤寒论》、《读素问钞》、《溪囊便方》、《启迪集》（日本抄本）等四部书，在吉林省乃至全国，也是罕见的珍贵版本，是 医学馆的镇馆之宝。而日本版古医书，数量之多，版本质量之高，名列全省榜首。
目前 医学馆提供的主要服务内容有：馆内阅览、图书外借、信息咨询、定题服务、电子文献及全文检索、计算机光盘与网络数据库检索、听音、多媒体光盘阅览、馆际互借、文献传递、文献复印等。此外，还不定期地举办各类计算机医学文献检索等专题讲座与培训。
现代图书馆人以研究型、主动性、开放式、电子化为服务宗旨，医学馆还将根据读者的要求不断扩大业务范围，改进服务手段，提高服务质量。
