明灯明

王朝百科·作者佚名  2010-06-19
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出生年月:1971年11月

职称:副教授

简历:

1991年9月-1995年7月哈尔滨工业大学应用化学系,高分子材料,学士

1995年9月-1998年7月华东理工大学化学系, 物理化学,硕士

1998年9月-2001年7月复旦大学物理系, 理论物理学,博士

2001年12月-2003年5月美国贝勒医学院,生物化学系,博士后

2003年6月-2003年11月美国克拉克大学化学系,化学系,博士后

2003年12月-2007年11月美国洛斯阿拉莫斯国家实验室,计算机与计算科学部, 博士后

2007年11月-2008年11月南京大学生命学院副教授

2008年12月- 至今 复旦大学生命学院副教授

主要研究方向:

粗粒化的生物分子动力学模拟方法;同源建模;蛋白质-小分子相互作用及蛋白质相互作用数据库;蛋白质功能推定。

在研项目:2009.01-2011.12,国家自然科学基金面上项目,编号30870509,蛋白质对接研究:动力学扰动分析方法。

获奖情况:

代表性论文和专著:

1.Dengming Ming, Judith Cohn & Michael E. Wall. 预测蛋白质功能位点之快速动力学微扰分析方法. BMC Struct Biol. 8:5 (2008)

2.Dengming Ming, Marian Anghel & Michael E. Wall. 蛋白质势能面中的隐性结构,Phys. Rev. E. 77(2 Pt 1):021902 (2008)

3.Dengming Ming, Michael E. Wall & Kevin Y. Sanbonmatsu. Agonauted蛋白结构域的运动分析, RNA干扰之催化引擎。BMC Bioinformatics 8:470 (2007)

4.Dengming Ming& Michael E. Wall. 于蛋白质之天然结合位点处的相互作用导致大的蛋白质动力学变化,J. Mol. Biol. 358: 213-23 (2006)

5.Dengming Ming& Michael E. Wall. 一个粗粒化的蛋白质动力学模型中的变构效应Phys. Rev. Lett. 95:198301. (2005)

6.Dengming Ming& Michael E. Wall. 蛋白质变构效应之定性分析. Proteins. 59: 697-707. (2005)

7.Dengming Ming& Rafael Brüschweiler. 预测蛋白质中含甲基的侧链的动力学 J Biomol NMR. 29:363-368. (2004)

8.Dengming Ming, Yifei Kong, Yinghao Wu & Jianpeng Ma. 模拟大分子复合物动力学的子结构合成方法。Proc Natl Acad Sci U S A. 100:104-9. (2003).

9.Dengming Ming, Yifei Kong, Yinghao Wu & Jianpeng Ma. 模拟几个微米长的F- actin 丝. Biophys J. 85:27-35.(2003)

10.Dengming Ming, Wen Tao, Jixian Dai, W. E. Evenson, Xianxi Dai.比热-声子谱逆问题的统一解。 Europhys. Lett. 61:723-728. (2003)

11.Dengming Ming, Yifei Kong, Maxime A. L., Zhong Huang & Jianpeng Ma. 在未知氨基酸序列和三维坐标的情况下如何描写蛋白质运动。Proc Natl Acad Sci U S A. 99:8620-5. (2002).

12.Dengming Ming, Wen Tao, Jixian Dai, W. E. Evenson, Xianxi Dai. 应用Möbius逆转公式得到的比热-声子谱问题的严格解。Phys. Rev. E. 62: R3019. (Rapid Communications 2000)

 
 
 
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